More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1637 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  94.62 
 
 		 1170 aa  2126    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  45.39 
 
 		 1164 aa  989    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1170 aa  2277    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  42.04 
 
 		 1153 aa  821    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  33.7 
 
 		 1174 aa  587  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1185 aa  489  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.79 
 
 		 1190 aa  476  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1185 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 		 1196 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 		 1187 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.54 
 
 		 1191 aa  456  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1190 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 		 1177 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1188 aa  439  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1188 aa  439  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.11 
 
 		 1174 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.43 
 
 		 1187 aa  436  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.41 
 
 		 1187 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.59 
 
 		 1186 aa  436  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.91 
 
 		 1185 aa  433  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.75 
 
 		 1184 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.44 
 
 		 1189 aa  429  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.35 
 
 		 1189 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.03 
 
 		 1179 aa  425  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.89 
 
 		 1189 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 		 1198 aa  425  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.98 
 
 		 1177 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.78 
 
 		 1189 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 		 1189 aa  422  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.78 
 
 		 1189 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.86 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.78 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 		 1186 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.86 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.7 
 
 		 1189 aa  416  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  30.89 
 
 		 1187 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.7 
 
 		 1189 aa  416  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1204 aa  406  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  28.47 
 
 		 1199 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.42 
 
 		 1175 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  28.95 
 
 		 1162 aa  403  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 		 1199 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1199 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1190 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.58 
 
 		 1191 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  28.79 
 
 		 1162 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.48 
 
 		 1177 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.57 
 
 		 1176 aa  396  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1176 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  29.49 
 
 		 1180 aa  396  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.69 
 
 		 1169 aa  392  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 		 1169 aa  390  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1164 aa  386  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1164 aa  386  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 		 1176 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.14 
 
 		 1168 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.64 
 
 		 1175 aa  386  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1184 aa  380  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.15 
 
 		 1173 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  28 
 
 		 1176 aa  383  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  29.7 
 
 		 1162 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1175 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 		 1181 aa  364  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.17 
 
 		 1178 aa  364  5.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 		 1164 aa  363  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  28.23 
 
 		 1163 aa  363  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1167 aa  360  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1201 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 		 1179 aa  356  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  27.45 
 
 		 1140 aa  355  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1403 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 		 1164 aa  350  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1176 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 		 1255 aa  349  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.9 
 
 		 1172 aa  350  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 		 1167 aa  348  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.58 
 
 		 1167 aa  348  4e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  27.54 
 
 		 1189 aa  345  4e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1224 aa  344  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.86 
 
 		 1189 aa  342  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 		 1194 aa  341  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.98 
 
 		 1177 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1148 aa  338  5e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.89 
 
 		 1178 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.09 
 
 		 1189 aa  334  6e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1301 aa  334  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1185 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1186 aa  330  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.59 
 
 		 1134 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 		 1150 aa  321  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 		 1150 aa  321  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1191 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 		 1189 aa  318  3e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.59 
 
 		 1193 aa  314  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.62 
 
 		 1174 aa  303  9e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  27.16 
 
 		 1175 aa  299  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  26.43 
 
 		 1190 aa  297  8e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1171 aa  296  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  26.49 
 
 		 1188 aa  288  5e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>