More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1220 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  45.14 
 
 		 1170 aa  952    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1164 aa  2288    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  44.8 
 
 		 1170 aa  953    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  44.85 
 
 		 1153 aa  895    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  31.82 
 
 		 1174 aa  535  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1187 aa  493  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.66 
 
 		 1187 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.94 
 
 		 1190 aa  465  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1185 aa  458  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.72 
 
 		 1185 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  32.66 
 
 		 1196 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1188 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1188 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 		 1186 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 		 1191 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.97 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.84 
 
 		 1189 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.64 
 
 		 1189 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.96 
 
 		 1189 aa  432  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.58 
 
 		 1189 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.72 
 
 		 1189 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.82 
 
 		 1189 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.87 
 
 		 1189 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.72 
 
 		 1189 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.58 
 
 		 1189 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.56 
 
 		 1186 aa  427  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.37 
 
 		 1177 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.72 
 
 		 1189 aa  426  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1190 aa  422  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 		 1198 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 		 1199 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.54 
 
 		 1174 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.98 
 
 		 1179 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  27.86 
 
 		 1199 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 		 1199 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.94 
 
 		 1184 aa  404  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1176 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1204 aa  396  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  27.86 
 
 		 1175 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.81 
 
 		 1185 aa  392  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  26.86 
 
 		 1173 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1176 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.53 
 
 		 1177 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  29.19 
 
 		 1180 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 		 1198 aa  386  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  28.72 
 
 		 1176 aa  383  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.13 
 
 		 1191 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 		 1176 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1176 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  28.93 
 
 		 1172 aa  375  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 		 1255 aa  369  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 		 1177 aa  366  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  26 
 
 		 1185 aa  356  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1181 aa  352  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 		 1176 aa  352  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.32 
 
 		 1169 aa  349  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 		 1169 aa  339  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.11 
 
 		 1178 aa  334  7.000000000000001e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1164 aa  332  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  25.99 
 
 		 1162 aa  331  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.88 
 
 		 1148 aa  330  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  25.92 
 
 		 1195 aa  329  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 		 1301 aa  328  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 		 1189 aa  327  6e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1184 aa  327  7e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1164 aa  326  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.71 
 
 		 1134 aa  325  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  26.49 
 
 		 1145 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1186 aa  321  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 		 1189 aa  321  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 		 1201 aa  318  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  25.2 
 
 		 1168 aa  317  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 		 1179 aa  315  3.9999999999999997e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  27.42 
 
 		 1172 aa  314  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.42 
 
 		 1189 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  25.25 
 
 		 1171 aa  312  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 		 1185 aa  311  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  25.54 
 
 		 1194 aa  311  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 		 1163 aa  310  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 		 1167 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  25.73 
 
 		 1164 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  24.46 
 
 		 1162 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  24.73 
 
 		 1162 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 		 1179 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 		 1167 aa  304  7.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  26.09 
 
 		 1141 aa  304  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 		 1403 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 		 1189 aa  301  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 		 1164 aa  299  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 		 1178 aa  297  9e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 		 1177 aa  293  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  24.78 
 
 		 1188 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  25.35 
 
 		 1074 aa  286  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1171 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1193 aa  285  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 		 1189 aa  282  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  24.63 
 
 		 1153 aa  277  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.63 
 
 		 1174 aa  273  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 		 1192 aa  273  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>