More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0708 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  79.06 
 
 
1189 aa  1857    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1189 aa  2345    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  59.35 
 
 
1191 aa  1318    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  79.73 
 
 
1189 aa  1879    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  79.56 
 
 
1189 aa  1896    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  33.04 
 
 
1174 aa  503  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  31.75 
 
 
1175 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  30.12 
 
 
1193 aa  443  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 
1171 aa  443  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 
1188 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 
1192 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 
1184 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 
1189 aa  422  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1146 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 
1146 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  30.17 
 
 
1172 aa  373  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 
1146 aa  370  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  29.4 
 
 
1196 aa  362  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 
1217 aa  360  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 
1147 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.9 
 
 
1196 aa  357  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.5 
 
 
1196 aa  352  3e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 
1185 aa  350  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.98 
 
 
1194 aa  349  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  26.69 
 
 
1219 aa  345  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  26.48 
 
 
1226 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.51 
 
 
1208 aa  336  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.17 
 
 
1190 aa  335  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 
1187 aa  333  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.22 
 
 
1189 aa  331  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.79 
 
 
1196 aa  326  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1188 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1188 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.76 
 
 
1189 aa  324  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.52 
 
 
1201 aa  324  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.94 
 
 
1207 aa  323  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.36 
 
 
1189 aa  321  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  26.66 
 
 
1183 aa  320  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 
1187 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1186 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.6 
 
 
1185 aa  305  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.76 
 
 
1177 aa  303  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 
1170 aa  302  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 
1164 aa  301  5e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.45 
 
 
1187 aa  301  6e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 
1170 aa  293  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 
1191 aa  292  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1177 aa  292  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.5 
 
 
1176 aa  289  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  23.77 
 
 
1199 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.66 
 
 
1174 aa  286  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 
1153 aa  281  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1176 aa  279  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  24.86 
 
 
1174 aa  278  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.87 
 
 
1179 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.04 
 
 
1172 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.53 
 
 
1184 aa  275  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.4 
 
 
1186 aa  275  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  23.93 
 
 
1176 aa  273  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.01 
 
 
1191 aa  273  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 
1199 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 
1199 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 
1190 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 
1176 aa  267  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.77 
 
 
1174 aa  263  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.37 
 
 
1134 aa  262  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.85 
 
 
1180 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.14 
 
 
1181 aa  255  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.2 
 
 
1178 aa  252  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  23.41 
 
 
1179 aa  248  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 
1255 aa  244  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.45 
 
 
1204 aa  238  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  27.75 
 
 
1202 aa  236  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.3 
 
 
1209 aa  236  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.86 
 
 
1189 aa  234  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.86 
 
 
1189 aa  234  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.73 
 
 
1189 aa  233  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  22.88 
 
 
1177 aa  233  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  25.22 
 
 
1171 aa  231  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.73 
 
 
1189 aa  231  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  23.37 
 
 
1173 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  22.16 
 
 
1188 aa  229  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.2 
 
 
1189 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 
1177 aa  229  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.79 
 
 
1189 aa  227  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 
1189 aa  227  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.79 
 
 
1189 aa  227  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  31.5 
 
 
1149 aa  227  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 
1198 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 
1189 aa  225  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 
1148 aa  225  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.16 
 
 
1476 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  23.54 
 
 
1403 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 
1185 aa  211  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  29.65 
 
 
1185 aa  211  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  22.55 
 
 
1215 aa  208  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  22.91 
 
 
1162 aa  206  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  22.88 
 
 
1168 aa  204  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  23.96 
 
 
1179 aa  203  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  22.29 
 
 
1162 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>