More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0889 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  41.91 
 
 		 1170 aa  817    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  44.85 
 
 		 1164 aa  920    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  41.57 
 
 		 1170 aa  822    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1153 aa  2227    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  32.43 
 
 		 1174 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 		 1196 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 		 1187 aa  426  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1185 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1187 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 		 1188 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 		 1188 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.83 
 
 		 1177 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.08 
 
 		 1185 aa  383  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.76 
 
 		 1190 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.36 
 
 		 1189 aa  380  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1186 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.49 
 
 		 1189 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 		 1189 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.49 
 
 		 1189 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.49 
 
 		 1187 aa  377  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  30.3 
 
 		 1180 aa  373  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 		 1190 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 		 1189 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.79 
 
 		 1189 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 		 1189 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.39 
 
 		 1189 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1191 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.23 
 
 		 1189 aa  373  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 		 1189 aa  370  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.61 
 
 		 1189 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.2 
 
 		 1186 aa  360  9e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.63 
 
 		 1184 aa  351  4e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  25.9 
 
 		 1187 aa  351  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 		 1190 aa  350  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.46 
 
 		 1174 aa  343  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  25.32 
 
 		 1173 aa  340  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1198 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.66 
 
 		 1179 aa  337  7e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.64 
 
 		 1204 aa  335  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1181 aa  334  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.49 
 
 		 1177 aa  334  5e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.35 
 
 		 1175 aa  334  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  25.73 
 
 		 1176 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.51 
 
 		 1191 aa  328  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 		 1177 aa  325  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 		 1176 aa  323  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1185 aa  318  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 		 1199 aa  317  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  23.96 
 
 		 1199 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.32 
 
 		 1199 aa  315  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1176 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  23.87 
 
 		 1198 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 		 1176 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.56 
 
 		 1176 aa  305  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 		 1184 aa  303  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 		 1189 aa  303  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  24.47 
 
 		 1255 aa  302  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.96 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.14 
 
 		 1189 aa  299  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  24.26 
 
 		 1176 aa  298  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  25.42 
 
 		 1162 aa  297  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.52 
 
 		 1178 aa  295  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 		 1189 aa  291  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  24.84 
 
 		 1162 aa  290  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 		 1172 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.64 
 
 		 1185 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  28.88 
 
 		 1082 aa  288  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  25.38 
 
 		 1169 aa  287  7e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  25.06 
 
 		 1162 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  23.82 
 
 		 1170 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1170 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  23.74 
 
 		 1170 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  24.58 
 
 		 1162 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  23.74 
 
 		 1170 aa  284  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1162 aa  283  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1169 aa  282  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  23.68 
 
 		 1206 aa  282  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 		 1170 aa  281  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 		 1177 aa  281  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.07 
 
 		 1134 aa  280  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  24.33 
 
 		 1167 aa  280  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  24.25 
 
 		 1167 aa  277  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 		 1268 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1186 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1198 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  22.18 
 
 		 1191 aa  274  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  23.56 
 
 		 1171 aa  274  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 		 1191 aa  274  8.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  23.76 
 
 		 1170 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  23.25 
 
 		 1164 aa  273  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 		 1200 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 		 1202 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  24.04 
 
 		 1171 aa  272  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  23.88 
 
 		 1170 aa  272  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  23.84 
 
 		 1170 aa  273  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.6 
 
 		 1179 aa  273  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  23.76 
 
 		 1170 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  23.2 
 
 		 1198 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  23.62 
 
 		 1172 aa  271  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  23.76 
 
 		 1170 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>