More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3002 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  68.06 
 
 
1189 aa  1508    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  68.09 
 
 
1196 aa  1422    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  72.23 
 
 
1188 aa  1619    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  41.65 
 
 
1175 aa  844    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  34.33 
 
 
1146 aa  637    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  39.98 
 
 
1174 aa  822    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  37.07 
 
 
1147 aa  650    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  35.69 
 
 
1146 aa  641    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  63.13 
 
 
1193 aa  1355    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  37.75 
 
 
1171 aa  702    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1192 aa  2338    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 
1146 aa  623  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  34.48 
 
 
1149 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 
1226 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 
1226 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  33.52 
 
 
1198 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 
1217 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  32.63 
 
 
1190 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  32.43 
 
 
1208 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.52 
 
 
1219 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.42 
 
 
1184 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.6 
 
 
1207 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.68 
 
 
1201 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.36 
 
 
1196 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.14 
 
 
1194 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 
1204 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 
1189 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.56 
 
 
1196 aa  479  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 
1189 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  30.16 
 
 
1196 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  31.07 
 
 
1183 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 
1191 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  30.13 
 
 
1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 
1189 aa  463  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.86 
 
 
1172 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  32.99 
 
 
1202 aa  443  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 
1148 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 
1185 aa  376  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.74 
 
 
1187 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.28 
 
 
1190 aa  353  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 
1191 aa  345  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  33.38 
 
 
1184 aa  340  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 
1190 aa  337  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.77 
 
 
1189 aa  333  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.35 
 
 
1174 aa  333  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.42 
 
 
1189 aa  331  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.74 
 
 
1189 aa  325  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  26.37 
 
 
1189 aa  324  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.05 
 
 
1187 aa  323  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 
1189 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 
1188 aa  323  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1187 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.6 
 
 
1189 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 
1188 aa  323  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 
1189 aa  323  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.48 
 
 
1189 aa  321  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.48 
 
 
1189 aa  321  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.61 
 
 
1185 aa  321  6e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.01 
 
 
1189 aa  320  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  25.76 
 
 
1185 aa  320  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.01 
 
 
1189 aa  320  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 
1189 aa  319  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 
1175 aa  318  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  27.16 
 
 
1177 aa  313  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26 
 
 
1164 aa  310  9e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  26.06 
 
 
1174 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.48 
 
 
1186 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  26.89 
 
 
1179 aa  304  6.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.57 
 
 
1191 aa  302  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.36 
 
 
1184 aa  302  3e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 
1148 aa  299  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 
1196 aa  298  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.17 
 
 
1170 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.99 
 
 
1172 aa  295  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.89 
 
 
1476 aa  293  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 
1170 aa  292  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 
1204 aa  291  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 
1198 aa  290  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  27.66 
 
 
1179 aa  290  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 
1177 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 
1181 aa  288  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.04 
 
 
1186 aa  284  6.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.92 
 
 
1180 aa  283  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  24.48 
 
 
1169 aa  283  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.14 
 
 
1171 aa  282  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  24.66 
 
 
1169 aa  278  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  27.43 
 
 
1187 aa  278  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  26.42 
 
 
1176 aa  275  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 
1176 aa  275  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.9 
 
 
1199 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.06 
 
 
1174 aa  275  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  25.83 
 
 
1167 aa  270  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  25.47 
 
 
1173 aa  269  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  24.98 
 
 
1082 aa  265  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 
1167 aa  264  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  25.77 
 
 
1167 aa  263  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.15 
 
 
1178 aa  260  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 
1167 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  26.11 
 
 
1176 aa  258  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  23.59 
 
 
1185 aa  258  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>