More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0947 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  100 
 
 
1082 aa  2078    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.79 
 
 
1187 aa  353  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 
1189 aa  344  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.27 
 
 
1189 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.79 
 
 
1189 aa  335  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.94 
 
 
1189 aa  335  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.34 
 
 
1189 aa  335  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.94 
 
 
1189 aa  335  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.94 
 
 
1189 aa  335  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.94 
 
 
1189 aa  335  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.61 
 
 
1189 aa  332  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.61 
 
 
1189 aa  332  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 
1185 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.39 
 
 
1189 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.58 
 
 
1189 aa  330  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1188 aa  322  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1188 aa  322  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.23 
 
 
1190 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.97 
 
 
1190 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.75 
 
 
1174 aa  296  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.79 
 
 
1184 aa  293  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 
1164 aa  289  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 
1170 aa  287  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 
1170 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 
1153 aa  284  7.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  28 
 
 
1172 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1186 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.86 
 
 
1186 aa  273  9e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.53 
 
 
1174 aa  268  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.57 
 
 
1177 aa  266  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 
1177 aa  264  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.39 
 
 
1191 aa  262  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.43 
 
 
1134 aa  257  8e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  23.29 
 
 
1187 aa  256  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.23 
 
 
1185 aa  253  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.94 
 
 
1191 aa  253  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  23.67 
 
 
1185 aa  252  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1186 aa  242  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1181 aa  241  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 
1172 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.77 
 
 
1175 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  25.11 
 
 
978 aa  225  4e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  23.68 
 
 
1162 aa  224  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.15 
 
 
1198 aa  220  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.93 
 
 
1177 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  22.03 
 
 
1190 aa  214  9e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  26.43 
 
 
1189 aa  212  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.71 
 
 
1196 aa  211  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  26.68 
 
 
1196 aa  210  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  24.45 
 
 
1147 aa  209  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 
1189 aa  209  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  26.35 
 
 
1189 aa  209  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.28 
 
 
1196 aa  206  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.84 
 
 
1179 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.33 
 
 
1194 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 
1192 aa  193  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  22.55 
 
 
1219 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1199 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1199 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  27.48 
 
 
1189 aa  182  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.84 
 
 
1199 aa  180  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 
1308 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  23.45 
 
 
1183 aa  171  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 
1184 aa  167  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.92 
 
 
1207 aa  167  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  23.27 
 
 
1301 aa  166  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1185 aa  161  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  31.97 
 
 
1191 aa  160  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  27.19 
 
 
1174 aa  160  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.3 
 
 
1403 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  23.42 
 
 
1177 aa  157  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 
1224 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 
1189 aa  155  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  23.9 
 
 
1146 aa  154  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 
1218 aa  152  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  29.76 
 
 
1194 aa  151  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1153 aa  151  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 
1194 aa  151  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  32.58 
 
 
1199 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  33.84 
 
 
1164 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 
1193 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 
1198 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  31.6 
 
 
1186 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  22.57 
 
 
1209 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  30.26 
 
 
1195 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  32.43 
 
 
1188 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  33.06 
 
 
1194 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  33.83 
 
 
1144 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  31.82 
 
 
1188 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  33.9 
 
 
1195 aa  148  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  33.9 
 
 
1195 aa  148  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  34.35 
 
 
1138 aa  148  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  29.49 
 
 
1318 aa  148  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  33.9 
 
 
1195 aa  148  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  34.32 
 
 
1194 aa  148  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  22.82 
 
 
1176 aa  148  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  36.32 
 
 
1145 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  36.48 
 
 
1142 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  34.75 
 
 
1167 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  36.32 
 
 
1142 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>