More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0425 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  46.95 
 
 		 1196 aa  1071    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  41.26 
 
 		 1190 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  59.18 
 
 		 1183 aa  1407    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  41.38 
 
 		 1208 aa  800    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  41.61 
 
 		 1226 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  62.46 
 
 		 1207 aa  1460    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1204 aa  2378    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  86.88 
 
 		 1202 aa  1937    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  45.42 
 
 		 1196 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  41.77 
 
 		 1226 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  42.56 
 
 		 1198 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  59.54 
 
 		 1201 aa  1441    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  74.3 
 
 		 1184 aa  1607    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  46.28 
 
 		 1194 aa  1044    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  40.56 
 
 		 1219 aa  809    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  46.32 
 
 		 1196 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  40.93 
 
 		 1217 aa  814    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.45 
 
 		 1175 aa  523  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.92 
 
 		 1174 aa  522  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 		 1192 aa  485  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.99 
 
 		 1171 aa  486  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 		 1189 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  32.6 
 
 		 1188 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  31.98 
 
 		 1193 aa  464  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1146 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1146 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1184 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 		 1172 aa  362  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 		 1189 aa  343  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  32.82 
 
 		 1146 aa  336  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.23 
 
 		 1148 aa  335  4e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  33.42 
 
 		 1147 aa  334  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  53.12 
 
 		 1195 aa  329  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  32.22 
 
 		 1149 aa  309  3e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1185 aa  291  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 		 1187 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1188 aa  285  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1188 aa  285  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 		 1196 aa  267  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.37 
 
 		 1185 aa  257  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 		 1186 aa  254  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.06 
 
 		 1198 aa  252  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.71 
 
 		 1190 aa  252  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  23.42 
 
 		 1190 aa  251  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.1 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.1 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  28.09 
 
 		 1187 aa  249  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  24.78 
 
 		 1189 aa  245  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  24.78 
 
 		 1189 aa  245  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  24.78 
 
 		 1189 aa  244  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 		 1189 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  24.63 
 
 		 1189 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  24.7 
 
 		 1189 aa  241  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  24.7 
 
 		 1189 aa  241  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.92 
 
 		 1191 aa  240  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25 
 
 		 1187 aa  239  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.95 
 
 		 1177 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  24.1 
 
 		 1189 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.1 
 
 		 1184 aa  236  3e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  23.17 
 
 		 1148 aa  231  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1191 aa  229  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.29 
 
 		 1174 aa  228  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.39 
 
 		 1186 aa  222  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 		 1179 aa  215  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.7 
 
 		 1185 aa  213  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  20.64 
 
 		 1180 aa  211  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 		 1186 aa  210  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.12 
 
 		 1164 aa  209  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1179 aa  209  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  23.11 
 
 		 1171 aa  207  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.66 
 
 		 1189 aa  205  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.37 
 
 		 1174 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.33 
 
 		 1189 aa  198  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  49.49 
 
 		 1196 aa  197  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1176 aa  196  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  25.7 
 
 		 1176 aa  196  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.39 
 
 		 1215 aa  195  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  23.41 
 
 		 1176 aa  194  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  26.56 
 
 		 1173 aa  194  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.16 
 
 		 1191 aa  194  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 		 1177 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 		 1187 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  24.58 
 
 		 1175 aa  189  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  21.74 
 
 		 1153 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1189 aa  184  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.27 
 
 		 1174 aa  182  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.09 
 
 		 1209 aa  180  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 		 1167 aa  179  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 		 1190 aa  173  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 		 1181 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1403 aa  171  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  25.08 
 
 		 1168 aa  171  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.47 
 
 		 1134 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  23.95 
 
 		 1308 aa  145  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  24.3 
 
 		 1232 aa  144  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  21.85 
 
 		 1178 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.39 
 
 		 1177 aa  141  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  39.39 
 
 		 1194 aa  140  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  38.61 
 
 		 1194 aa  138  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  38.63 
 
 		 1191 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>