More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0059 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  77.47 
 
 
1194 aa  1833    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  92.47 
 
 
1196 aa  2156    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  49.04 
 
 
1183 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  37.78 
 
 
1208 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  38.02 
 
 
1226 aa  703    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 
1204 aa  1022    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  47.95 
 
 
1207 aa  1012    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  45.6 
 
 
1202 aa  1007    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  100 
 
 
1196 aa  2371    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  91.39 
 
 
1196 aa  2137    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  49.43 
 
 
1201 aa  1040    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  45.58 
 
 
1184 aa  987    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  37 
 
 
1217 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  36.96 
 
 
1219 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  35.73 
 
 
1198 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  37.86 
 
 
1190 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  38.15 
 
 
1226 aa  705    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  32.28 
 
 
1174 aa  516  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.52 
 
 
1171 aa  492  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 
1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 
1193 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  29.78 
 
 
1192 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 
1146 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1147 aa  438  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.83 
 
 
1149 aa  433  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 
1189 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28.94 
 
 
1189 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 
1189 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 
1191 aa  361  5e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  30.4 
 
 
1172 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  60.5 
 
 
1195 aa  315  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.57 
 
 
1185 aa  312  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 
1187 aa  277  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 
1191 aa  259  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 
1196 aa  249  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 
1187 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 
1146 aa  245  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 
1148 aa  236  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24 
 
 
1185 aa  233  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1189 aa  232  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.45 
 
 
1184 aa  227  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.74 
 
 
1134 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.86 
 
 
1177 aa  220  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  49.76 
 
 
1175 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.02 
 
 
1191 aa  215  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  25.16 
 
 
1174 aa  210  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.83 
 
 
1180 aa  206  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 
1188 aa  205  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.43 
 
 
1148 aa  206  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.53 
 
 
1178 aa  206  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  26.7 
 
 
1082 aa  205  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  37.96 
 
 
1196 aa  205  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  23.67 
 
 
1176 aa  201  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 
1188 aa  194  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  22.49 
 
 
1209 aa  194  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 
1188 aa  194  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 
1178 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  36.6 
 
 
1146 aa  191  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.8 
 
 
1179 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.15 
 
 
1215 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.81 
 
 
1190 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 
1175 aa  182  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.17 
 
 
1198 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 
1174 aa  178  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  22.25 
 
 
1164 aa  177  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 
1185 aa  174  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  22.99 
 
 
1176 aa  173  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 
1189 aa  171  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.1 
 
 
1189 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.1 
 
 
1189 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.34 
 
 
1189 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 
1189 aa  170  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.1 
 
 
1189 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.1 
 
 
1189 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.39 
 
 
1164 aa  168  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.07 
 
 
1189 aa  167  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  39.8 
 
 
1184 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  22.9 
 
 
1232 aa  164  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  27.68 
 
 
1187 aa  164  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  26.63 
 
 
1179 aa  157  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.03 
 
 
1189 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.03 
 
 
1189 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.28 
 
 
1204 aa  152  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.29 
 
 
1186 aa  151  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 
1201 aa  144  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 
1181 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 
1153 aa  138  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  35.85 
 
 
1194 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  23.77 
 
 
1171 aa  132  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  23.39 
 
 
1176 aa  132  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  35.14 
 
 
1203 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  37.95 
 
 
1194 aa  130  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  34.91 
 
 
1194 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  39.49 
 
 
1188 aa  129  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  36.4 
 
 
1185 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 
1217 aa  129  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  29.32 
 
 
980 aa  128  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 
1179 aa  127  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  34.53 
 
 
1195 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  24.9 
 
 
1011 aa  127  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>