More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0747 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1146 aa  2293    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  57.55 
 
 
1146 aa  1258    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  37.38 
 
 
1175 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  46.13 
 
 
1149 aa  981    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 
1146 aa  974    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  36.28 
 
 
1174 aa  649    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  56.89 
 
 
1147 aa  1221    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  36.25 
 
 
1188 aa  634  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  35.02 
 
 
1193 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  34.91 
 
 
1192 aa  602  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  34.99 
 
 
1171 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  34.32 
 
 
1189 aa  584  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  34.51 
 
 
1196 aa  554  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.92 
 
 
1219 aa  509  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  32.76 
 
 
1226 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  32.02 
 
 
1226 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 
1217 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.14 
 
 
1194 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.43 
 
 
1196 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  30.46 
 
 
1196 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.15 
 
 
1196 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  30.21 
 
 
1183 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.98 
 
 
1172 aa  399  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 
1189 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1189 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28.35 
 
 
1189 aa  380  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 
1191 aa  373  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  32.37 
 
 
1190 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  33.43 
 
 
1198 aa  344  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  33.48 
 
 
1208 aa  337  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  32.87 
 
 
1204 aa  322  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 
1187 aa  319  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  33.62 
 
 
1184 aa  310  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.9 
 
 
1191 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 
1187 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 
1186 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.72 
 
 
1207 aa  291  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 
1185 aa  290  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.41 
 
 
1188 aa  289  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.41 
 
 
1188 aa  289  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 
1189 aa  289  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.25 
 
 
1190 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 
1189 aa  282  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 
1196 aa  281  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  26.87 
 
 
1175 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.14 
 
 
1180 aa  275  5.000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1189 aa  274  9e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  24.48 
 
 
1189 aa  268  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.06 
 
 
1174 aa  266  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 
1177 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 
1204 aa  262  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  25.23 
 
 
1174 aa  258  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.54 
 
 
1181 aa  257  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  26.51 
 
 
1176 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1164 aa  256  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.05 
 
 
1199 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 
1148 aa  251  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 
1170 aa  249  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.73 
 
 
1179 aa  248  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 
1176 aa  249  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 
1199 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  25.88 
 
 
1176 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 
1199 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  25.08 
 
 
1209 aa  245  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 
1177 aa  244  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  25.78 
 
 
1176 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.54 
 
 
1184 aa  230  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  26.05 
 
 
1173 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 
1185 aa  221  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.92 
 
 
1153 aa  221  7.999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.72 
 
 
1186 aa  220  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 
1174 aa  220  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 
1177 aa  219  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.39 
 
 
1189 aa  211  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  23.68 
 
 
1169 aa  210  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  25.84 
 
 
1225 aa  209  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  23.75 
 
 
1169 aa  208  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  24.98 
 
 
1356 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 
1185 aa  204  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  50 
 
 
1195 aa  204  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.48 
 
 
1189 aa  201  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.02 
 
 
1189 aa  201  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.02 
 
 
1189 aa  201  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  27.06 
 
 
1185 aa  201  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.45 
 
 
1189 aa  201  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.45 
 
 
1189 aa  201  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.33 
 
 
1189 aa  201  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.17 
 
 
1189 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.89 
 
 
1189 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.87 
 
 
1403 aa  194  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  24.71 
 
 
1232 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 
1179 aa  191  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  24.88 
 
 
1171 aa  191  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.61 
 
 
1191 aa  191  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  26.13 
 
 
1215 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  24.12 
 
 
1179 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 
1170 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  49.22 
 
 
1184 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 
1177 aa  182  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 
1185 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>