More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0592 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 
1189 aa  822    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  100 
 
 
1175 aa  2349    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  42 
 
 
1196 aa  786    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  40.3 
 
 
1193 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  41.81 
 
 
1188 aa  843    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  61.04 
 
 
1174 aa  1439    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  37.22 
 
 
1146 aa  651    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  41.66 
 
 
1192 aa  814    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  42.46 
 
 
1171 aa  929    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  35.56 
 
 
1146 aa  623  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  36.23 
 
 
1147 aa  621  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  33.86 
 
 
1146 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  35.52 
 
 
1149 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  34.97 
 
 
1184 aa  586  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  33.41 
 
 
1208 aa  582  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1198 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  33.77 
 
 
1190 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 
1226 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  33.76 
 
 
1226 aa  566  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  33.23 
 
 
1217 aa  551  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  32.68 
 
 
1219 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.92 
 
 
1207 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.94 
 
 
1201 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.78 
 
 
1196 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.26 
 
 
1194 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  32.76 
 
 
1204 aa  509  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  32.22 
 
 
1183 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  31.53 
 
 
1191 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 
1189 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  32.42 
 
 
1189 aa  489  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  31.74 
 
 
1189 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 
1189 aa  463  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 
1172 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.47 
 
 
1185 aa  383  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 
1187 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.71 
 
 
1190 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.08 
 
 
1190 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 
1191 aa  355  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.51 
 
 
1185 aa  352  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.79 
 
 
1196 aa  352  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  34.79 
 
 
1202 aa  348  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  33.73 
 
 
1184 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 
1198 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.79 
 
 
1189 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.44 
 
 
1189 aa  338  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 
1186 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 
1188 aa  332  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 
1188 aa  332  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.69 
 
 
1185 aa  332  4e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 
1189 aa  330  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.89 
 
 
1184 aa  329  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 
1189 aa  328  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.84 
 
 
1189 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.84 
 
 
1189 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.1 
 
 
1174 aa  324  7e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.25 
 
 
1187 aa  323  9.000000000000001e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.54 
 
 
1189 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.76 
 
 
1189 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.54 
 
 
1189 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.76 
 
 
1189 aa  323  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  26.86 
 
 
1189 aa  322  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.32 
 
 
1189 aa  314  4.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1177 aa  311  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 
1174 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  26.17 
 
 
1179 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.56 
 
 
1186 aa  304  7.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  27.04 
 
 
1176 aa  292  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.8 
 
 
1209 aa  288  5.999999999999999e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 
1199 aa  288  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 
1198 aa  287  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.48 
 
 
1199 aa  287  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27 
 
 
1170 aa  287  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 
1199 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.98 
 
 
1170 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 
1204 aa  284  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.58 
 
 
1175 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.06 
 
 
1177 aa  279  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  25.74 
 
 
1176 aa  278  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  23.97 
 
 
1178 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 
1148 aa  275  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 
1186 aa  268  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  25.87 
 
 
1178 aa  266  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1181 aa  266  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 
1164 aa  265  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  25.65 
 
 
1232 aa  263  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  26.06 
 
 
1179 aa  260  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 
1177 aa  260  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  25.33 
 
 
1215 aa  258  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.46 
 
 
1476 aa  258  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.16 
 
 
1180 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 
1148 aa  255  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  26.39 
 
 
1173 aa  251  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.48 
 
 
1176 aa  248  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  24.7 
 
 
1179 aa  245  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  24.84 
 
 
1208 aa  242  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  24.44 
 
 
1240 aa  243  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.04 
 
 
1134 aa  239  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 
1153 aa  238  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  25.61 
 
 
1168 aa  237  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.8 
 
 
1174 aa  234  8.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>