More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02930 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  48.53 
 
 
1215 aa  1093    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  100 
 
 
1208 aa  2460    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  37.03 
 
 
1011 aa  640    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  37.42 
 
 
1232 aa  728    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  37.27 
 
 
1209 aa  756    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 
1171 aa  266  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 
1185 aa  258  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.02 
 
 
1149 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.41 
 
 
1191 aa  242  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  24.72 
 
 
1175 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.32 
 
 
1174 aa  232  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.29 
 
 
1171 aa  229  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 
1146 aa  227  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.64 
 
 
1146 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  25.49 
 
 
1213 aa  224  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.01 
 
 
1187 aa  222  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.45 
 
 
1181 aa  213  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  24.98 
 
 
1147 aa  211  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 
1186 aa  209  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.03 
 
 
1170 aa  206  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.29 
 
 
1189 aa  204  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  23.57 
 
 
1208 aa  201  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.68 
 
 
1164 aa  198  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  22.72 
 
 
1185 aa  197  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  23.16 
 
 
1174 aa  195  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.4 
 
 
1217 aa  195  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23.52 
 
 
1170 aa  191  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44736  predicted protein  73.17 
 
 
153 aa  189  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0727103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 
1191 aa  184  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.42 
 
 
1174 aa  183  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  23.14 
 
 
1186 aa  183  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  21.82 
 
 
1178 aa  181  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.6 
 
 
1193 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  23.33 
 
 
1186 aa  172  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.53 
 
 
1174 aa  172  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.04 
 
 
1148 aa  166  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.77 
 
 
1194 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 
1184 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 
1189 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  23.65 
 
 
1179 aa  164  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  25.78 
 
 
1190 aa  162  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 
1172 aa  161  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  24.42 
 
 
1175 aa  157  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  24.72 
 
 
1187 aa  157  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.23 
 
 
1189 aa  153  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  23.2 
 
 
1167 aa  152  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.69 
 
 
1196 aa  148  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  23.72 
 
 
1167 aa  145  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.5 
 
 
1226 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  25.9 
 
 
1196 aa  143  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  22.13 
 
 
1202 aa  142  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 
1226 aa  141  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.19 
 
 
1196 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  24.05 
 
 
1202 aa  134  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.8 
 
 
1207 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  23.93 
 
 
1356 aa  133  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.62 
 
 
1204 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  24.72 
 
 
1173 aa  132  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.76 
 
 
1199 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.62 
 
 
1199 aa  132  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  25.14 
 
 
1186 aa  131  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.34 
 
 
1199 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  23.4 
 
 
1204 aa  128  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  24.62 
 
 
1196 aa  128  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  23.64 
 
 
1172 aa  128  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  26.41 
 
 
1146 aa  126  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.06 
 
 
1180 aa  126  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  22.03 
 
 
1540 aa  124  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  24.75 
 
 
1185 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.03 
 
 
1219 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 
1192 aa  118  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 
1188 aa  114  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  31.07 
 
 
1189 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  38.16 
 
 
1183 aa  107  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  22.71 
 
 
1301 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 
1189 aa  107  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  38.16 
 
 
1201 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 
1189 aa  105  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1201 aa  104  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1185 aa  104  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  29.82 
 
 
1225 aa  103  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  23.67 
 
 
1255 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 
1191 aa  102  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 
1164 aa  102  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.41 
 
 
1134 aa  102  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  29.02 
 
 
1184 aa  102  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.22 
 
 
1182 aa  102  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 
1171 aa  101  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 
1171 aa  101  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1172 aa  100  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  26.42 
 
 
1198 aa  100  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  27.97 
 
 
1171 aa  100  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  29.33 
 
 
1222 aa  100  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  27.11 
 
 
1213 aa  99.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 
1198 aa  99.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  28.38 
 
 
1217 aa  99.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  22.87 
 
 
1177 aa  99  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  24.2 
 
 
1224 aa  98.6  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  29.29 
 
 
1139 aa  98.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  25.61 
 
 
1170 aa  98.2  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>