More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_641 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  39.56 
 
 		 1215 aa  699    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  100 
 
 		 1011 aa  2044    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  37.03 
 
 		 1208 aa  628  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  32.18 
 
 		 1209 aa  508  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  32.35 
 
 		 1232 aa  462  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  23.81 
 
 		 1185 aa  180  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  23.11 
 
 		 1171 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  24.5 
 
 		 1190 aa  172  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 		 1177 aa  168  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.87 
 
 		 1187 aa  164  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  23.3 
 
 		 1184 aa  164  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  26.26 
 
 		 1171 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  26.16 
 
 		 1179 aa  159  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  23.55 
 
 		 1185 aa  157  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  24.18 
 
 		 1213 aa  155  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.31 
 
 		 1164 aa  152  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23.76 
 
 		 1170 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 		 1172 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.71 
 
 		 1174 aa  149  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.27 
 
 		 1187 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  22.88 
 
 		 1187 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  22.35 
 
 		 1198 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 		 1190 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.66 
 
 		 1170 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1192 aa  141  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1189 aa  140  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  22.16 
 
 		 1176 aa  138  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  24.06 
 
 		 1191 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  23.98 
 
 		 1191 aa  137  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.01 
 
 		 1191 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  22.8 
 
 		 1189 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  22.93 
 
 		 1189 aa  135  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  23.07 
 
 		 1189 aa  135  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  23.27 
 
 		 1174 aa  135  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.66 
 
 		 1184 aa  135  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.54 
 
 		 1181 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  21.31 
 
 		 1189 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.34 
 
 		 1188 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  22.2 
 
 		 1175 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  22.42 
 
 		 1175 aa  131  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  25.43 
 
 		 1215 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  23.08 
 
 		 1189 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  25.07 
 
 		 1185 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.66 
 
 		 1188 aa  129  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.11 
 
 		 1146 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.66 
 
 		 1188 aa  129  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  23.27 
 
 		 1185 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  24.9 
 
 		 1196 aa  128  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.98 
 
 		 1189 aa  125  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.04 
 
 		 1189 aa  125  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  22.12 
 
 		 1186 aa  123  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  22.93 
 
 		 1189 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  24.37 
 
 		 1196 aa  122  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  22.95 
 
 		 1204 aa  122  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.37 
 
 		 1196 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.34 
 
 		 1189 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.3 
 
 		 1194 aa  122  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.14 
 
 		 1196 aa  119  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  22.19 
 
 		 1179 aa  119  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  21.68 
 
 		 1198 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  22.36 
 
 		 1179 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  22.46 
 
 		 1196 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 		 1153 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  23.07 
 
 		 1146 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  22.5 
 
 		 1219 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  33.17 
 
 		 1186 aa  112  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  22.32 
 
 		 1187 aa  111  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.78 
 
 		 1201 aa  110  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  21.97 
 
 		 1186 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  22.93 
 
 		 1178 aa  108  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  22.39 
 
 		 978 aa  108  6e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  24.51 
 
 		 1140 aa  107  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  23.72 
 
 		 1183 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  21.23 
 
 		 1178 aa  105  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1133 aa  104  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  23.91 
 
 		 1169 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  22.08 
 
 		 1184 aa  103  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  22.28 
 
 		 1176 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  23.11 
 
 		 1204 aa  103  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  21.86 
 
 		 1175 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.78 
 
 		 1174 aa  102  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 		 299 aa  102  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  23.13 
 
 		 1226 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  22.35 
 
 		 1217 aa  101  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 		 1169 aa  101  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  22.55 
 
 		 1163 aa  99.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1164 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 		 1174 aa  99.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1170 aa  100  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  22.93 
 
 		 1168 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1164 aa  100  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  27.59 
 
 		 1177 aa  98.6  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  21.78 
 
 		 1142 aa  98.2  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  24.14 
 
 		 1139 aa  97.8  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 		 1142 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  25 
 
 		 1145 aa  97.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  23.29 
 
 		 1145 aa  97.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  24.09 
 
 		 1167 aa  96.3  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  28.68 
 
 		 1195 aa  96.3  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 		 1138 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>