More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04180 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  52.39 
 
 
1179 aa  1209    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  100 
 
 
1215 aa  2461    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  43.88 
 
 
1171 aa  980    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  42.72 
 
 
1186 aa  857    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  39.28 
 
 
1213 aa  759    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 
1193 aa  272  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.55 
 
 
1184 aa  249  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 
1187 aa  249  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 
1188 aa  247  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1192 aa  245  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.88 
 
 
1174 aa  244  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.72 
 
 
1189 aa  244  7.999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.6 
 
 
1209 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  24.58 
 
 
1191 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.69 
 
 
1189 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.31 
 
 
1177 aa  212  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.18 
 
 
1189 aa  211  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.53 
 
 
1170 aa  211  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  23.68 
 
 
1187 aa  211  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.54 
 
 
1189 aa  210  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.15 
 
 
1188 aa  209  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.15 
 
 
1188 aa  209  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.63 
 
 
1217 aa  208  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  23.61 
 
 
1189 aa  207  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23.17 
 
 
1170 aa  207  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  24.27 
 
 
1196 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  23.83 
 
 
1189 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.93 
 
 
1174 aa  200  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.57 
 
 
1189 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  23.63 
 
 
1199 aa  199  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  26.12 
 
 
1215 aa  197  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  23.71 
 
 
1196 aa  197  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  23.32 
 
 
1199 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 
1199 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.49 
 
 
1176 aa  194  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  23.5 
 
 
1146 aa  194  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 
1189 aa  192  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.08 
 
 
1191 aa  188  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  22.71 
 
 
1190 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  22.46 
 
 
1181 aa  186  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  22.74 
 
 
1184 aa  186  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  22.87 
 
 
1219 aa  184  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.38 
 
 
1174 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  23.18 
 
 
1189 aa  181  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  24.69 
 
 
1177 aa  181  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 
1147 aa  181  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  22.97 
 
 
1177 aa  180  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  24.03 
 
 
1176 aa  178  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  23.65 
 
 
1184 aa  176  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.46 
 
 
1153 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  22.98 
 
 
1190 aa  168  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  22.58 
 
 
1191 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  22.87 
 
 
1176 aa  164  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  23.11 
 
 
1186 aa  162  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  22.92 
 
 
1226 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  23.22 
 
 
1204 aa  160  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  23.72 
 
 
1175 aa  160  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 
1170 aa  158  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  23.72 
 
 
1201 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26 
 
 
1172 aa  154  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  23.25 
 
 
1268 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  22.41 
 
 
1176 aa  152  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  21.98 
 
 
1185 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 
1148 aa  147  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  25.36 
 
 
1011 aa  145  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  25.56 
 
 
1185 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  23.48 
 
 
1186 aa  141  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  23.22 
 
 
1198 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  24.32 
 
 
1185 aa  137  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  25.56 
 
 
1190 aa  135  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 
1226 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  23.27 
 
 
1185 aa  134  7.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  25.29 
 
 
1204 aa  132  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.68 
 
 
1187 aa  132  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  22.03 
 
 
1190 aa  129  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 
1540 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  24.57 
 
 
1179 aa  127  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  22.47 
 
 
1189 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  23.22 
 
 
1208 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  21.91 
 
 
1189 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  21.91 
 
 
1189 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  21.76 
 
 
1189 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  22.17 
 
 
1189 aa  121  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  29.15 
 
 
1162 aa  121  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  22.17 
 
 
1189 aa  121  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.7 
 
 
1196 aa  122  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  22.17 
 
 
1189 aa  121  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  30.58 
 
 
1162 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1164 aa  120  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  21.67 
 
 
1185 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  23.59 
 
 
1175 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  23.22 
 
 
1187 aa  119  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.83 
 
 
1476 aa  119  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.01 
 
 
1194 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  24.75 
 
 
1202 aa  117  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  22.55 
 
 
1146 aa  116  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.44 
 
 
1162 aa  116  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  29.51 
 
 
1162 aa  116  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  33.02 
 
 
1163 aa  116  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  23.51 
 
 
1149 aa  115  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>