More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30352 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  39.31 
 
 		 1179 aa  803    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  45.59 
 
 		 1186 aa  917    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  100 
 
 		 1213 aa  2468    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  39.25 
 
 		 1215 aa  755    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  37.42 
 
 		 1171 aa  709    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  25.48 
 
 		 1215 aa  256  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.19 
 
 		 1209 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1185 aa  228  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 		 1187 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.6 
 
 		 1174 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  23.94 
 
 		 1175 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  22.62 
 
 		 1189 aa  210  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  22.2 
 
 		 1187 aa  210  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 		 1189 aa  205  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23.76 
 
 		 1170 aa  204  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 		 1146 aa  204  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 		 1170 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  22.4 
 
 		 1188 aa  202  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  22.4 
 
 		 1188 aa  202  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.91 
 
 		 1196 aa  190  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  22.89 
 
 		 1226 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  23.34 
 
 		 1190 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.66 
 
 		 1174 aa  180  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  23.27 
 
 		 1191 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  22.59 
 
 		 1226 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  24.49 
 
 		 1147 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  23.98 
 
 		 1184 aa  171  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.81 
 
 		 1153 aa  168  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  23.9 
 
 		 1181 aa  165  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  23.85 
 
 		 1176 aa  162  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  26.27 
 
 		 1208 aa  159  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  22.67 
 
 		 1176 aa  157  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  24.18 
 
 		 1011 aa  155  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.03 
 
 		 1179 aa  155  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.48 
 
 		 1174 aa  154  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  23.45 
 
 		 1186 aa  147  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.09 
 
 		 1184 aa  138  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.26 
 
 		 1196 aa  134  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.14 
 
 		 1185 aa  134  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 		 1217 aa  132  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.96 
 
 		 1403 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 		 1193 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  26.23 
 
 		 1204 aa  127  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  24.25 
 
 		 1198 aa  124  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 		 1540 aa  120  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1188 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.88 
 
 		 1219 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  28.23 
 
 		 1191 aa  118  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 		 1171 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  31.03 
 
 		 1198 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1153 aa  116  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1164 aa  115  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 		 1194 aa  115  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1198 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  27.11 
 
 		 1186 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 		 1186 aa  114  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 		 1191 aa  112  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  27.38 
 
 		 1227 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.44 
 
 		 1174 aa  112  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  28.63 
 
 		 1217 aa  111  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 		 1234 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.81 
 
 		 1199 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  24.83 
 
 		 1232 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  30.57 
 
 		 1162 aa  110  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 		 1191 aa  110  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 		 1194 aa  110  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 		 1150 aa  110  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  29.05 
 
 		 1195 aa  110  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  27.02 
 
 		 1188 aa  110  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.78 
 
 		 1199 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.07 
 
 		 1190 aa  109  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 		 1163 aa  109  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  29.69 
 
 		 1162 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 		 1217 aa  108  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 		 1203 aa  108  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1162 aa  108  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 		 1194 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1162 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  32.31 
 
 		 1165 aa  107  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1162 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 		 1199 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 		 1162 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 		 1263 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  29.06 
 
 		 1225 aa  106  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 		 1162 aa  106  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  28.4 
 
 		 1148 aa  106  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 		 1194 aa  106  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  29.05 
 
 		 1222 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1172 aa  105  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.7 
 
 		 1169 aa  105  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 		 1169 aa  105  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.78 
 
 		 1177 aa  104  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  34.57 
 
 		 1191 aa  104  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  25.88 
 
 		 980 aa  103  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  27.66 
 
 		 1307 aa  103  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 		 1133 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  24.11 
 
 		 1198 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1168 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  34.3 
 
 		 1189 aa  102  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1162 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>