More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2898 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  42.29 
 
 		 1162 aa  752    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  39.43 
 
 		 1169 aa  718    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  37.58 
 
 		 1171 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 		 1198 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  100 
 
 		 1145 aa  2301    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  41.88 
 
 		 1162 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  74.5 
 
 		 1138 aa  1610    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  41.28 
 
 		 1162 aa  772    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  42.42 
 
 		 1162 aa  755    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  38.47 
 
 		 1167 aa  673    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  39.41 
 
 		 1164 aa  715    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  39.59 
 
 		 1164 aa  713    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  50.81 
 
 		 1139 aa  1031    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  41.88 
 
 		 1162 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  38.03 
 
 		 1167 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  37.53 
 
 		 1171 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  39.17 
 
 		 1165 aa  668    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  37.83 
 
 		 1165 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  42 
 
 		 1162 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  42.96 
 
 		 1162 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  38.91 
 
 		 1167 aa  682    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  48.73 
 
 		 814 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  41.58 
 
 		 1163 aa  759    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  39.23 
 
 		 1167 aa  716    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.88 
 
 		 1168 aa  733    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  53.54 
 
 		 1141 aa  1071    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  55.2 
 
 		 1133 aa  1130    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  39.87 
 
 		 1168 aa  729    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  38.88 
 
 		 1198 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  52.69 
 
 		 1138 aa  1023    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  38.74 
 
 		 1175 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  40.84 
 
 		 1164 aa  745    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  37.2 
 
 		 1171 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  39.3 
 
 		 1169 aa  711    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  36.91 
 
 		 1164 aa  677    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  42.67 
 
 		 1164 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  74.59 
 
 		 1138 aa  1610    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.46 
 
 		 1162 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  89.69 
 
 		 1142 aa  1973    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  89.69 
 
 		 1142 aa  1975    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  40.06 
 
 		 1168 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  54.42 
 
 		 1144 aa  1052    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  74.93 
 
 		 1138 aa  1616    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  74.85 
 
 		 1138 aa  1617    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  41.7 
 
 		 1162 aa  765    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  42.24 
 
 		 1162 aa  754    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.19 
 
 		 1162 aa  758    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  38.96 
 
 		 1167 aa  682    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  90.57 
 
 		 1142 aa  1979    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  53.53 
 
 		 1140 aa  1055    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  77.35 
 
 		 1145 aa  1710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  37.06 
 
 		 1170 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1170 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1170 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  36.82 
 
 		 1170 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  36.96 
 
 		 1175 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  37.1 
 
 		 1172 aa  629  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 		 1170 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 		 1170 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  36.99 
 
 		 1175 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  37.41 
 
 		 1170 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  37.42 
 
 		 1206 aa  622  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  37.54 
 
 		 1174 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  37.46 
 
 		 1174 aa  622  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  36.89 
 
 		 1268 aa  619  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1170 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1202 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.47 
 
 		 1182 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1200 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 		 1170 aa  619  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  37.26 
 
 		 1171 aa  616  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  36.68 
 
 		 1170 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  36.89 
 
 		 1181 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  37.12 
 
 		 1171 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  37.12 
 
 		 1190 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  36.53 
 
 		 1142 aa  592  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.99 
 
 		 1167 aa  524  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.54 
 
 		 1175 aa  499  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1150 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1150 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  76.79 
 
 		 299 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1176 aa  465  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 		 1187 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.62 
 
 		 1190 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  58.72 
 
 		 1195 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 		 1188 aa  396  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 		 1188 aa  396  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.23 
 
 		 1184 aa  394  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1190 aa  393  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  52.94 
 
 		 1170 aa  386  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 		 1185 aa  386  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1170 aa  363  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 		 1170 aa  346  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  35.54 
 
 		 1204 aa  339  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  38.74 
 
 		 1234 aa  330  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  51.05 
 
 		 1171 aa  327  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  49.56 
 
 		 1170 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  46.45 
 
 		 1109 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  33.58 
 
 		 1152 aa  305  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 		 1181 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>