More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2594 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  58.26 
 
 
1171 aa  1290    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  50.04 
 
 
1152 aa  1033    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  38.08 
 
 
1168 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  38.03 
 
 
1162 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  58.04 
 
 
1170 aa  1281    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  57.87 
 
 
1170 aa  1257    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  38 
 
 
1162 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  39.59 
 
 
1162 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  47.19 
 
 
1167 aa  948    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  58.91 
 
 
1171 aa  1313    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  70.46 
 
 
1175 aa  1641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  46.76 
 
 
1165 aa  924    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  58.54 
 
 
1198 aa  1286    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  57.78 
 
 
1170 aa  1256    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  57.87 
 
 
1268 aa  1260    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  37.76 
 
 
1162 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  58.29 
 
 
1170 aa  1286    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  72.4 
 
 
1175 aa  1652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  76.55 
 
 
1175 aa  1760    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 
1190 aa  843    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  57.66 
 
 
1171 aa  1294    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  58.12 
 
 
1170 aa  1267    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  77.44 
 
 
1174 aa  1768    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  74.17 
 
 
1204 aa  1700    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  79.25 
 
 
1171 aa  1836    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.73 
 
 
1168 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  42.2 
 
 
1168 aa  796    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1182 aa  2372    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  58.43 
 
 
1198 aa  1287    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  45.21 
 
 
1234 aa  885    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  79 
 
 
1171 aa  1793    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  58.25 
 
 
1171 aa  1315    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  57.95 
 
 
1170 aa  1259    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  57.87 
 
 
1170 aa  1276    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  51.18 
 
 
1173 aa  1103    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  57.78 
 
 
1200 aa  1257    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  66.5 
 
 
1170 aa  1481    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  85.1 
 
 
1181 aa  1957    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  39 
 
 
1162 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  57.54 
 
 
1142 aa  1229    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.37 
 
 
1162 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  57.61 
 
 
1172 aa  1251    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  58.63 
 
 
1206 aa  1273    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  57.95 
 
 
1170 aa  1278    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  57.95 
 
 
1170 aa  1259    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  57.95 
 
 
1170 aa  1279    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  37.55 
 
 
1162 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  77.35 
 
 
1174 aa  1754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  57.78 
 
 
1202 aa  1256    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  37.38 
 
 
1162 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  36.99 
 
 
1162 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  36.13 
 
 
1163 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  34.97 
 
 
1169 aa  617  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35 
 
 
1169 aa  617  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  37.16 
 
 
1170 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  37.53 
 
 
1167 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.94 
 
 
1167 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  35.94 
 
 
1167 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.06 
 
 
1142 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  36.49 
 
 
1142 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  36.35 
 
 
1164 aa  598  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 
1142 aa  599  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  35.86 
 
 
1145 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  35.27 
 
 
1164 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  34.61 
 
 
1138 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  36.31 
 
 
1167 aa  591  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.14 
 
 
1164 aa  589  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  35.32 
 
 
1145 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  37.6 
 
 
1168 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  35.63 
 
 
1141 aa  572  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  34.74 
 
 
1150 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.74 
 
 
1150 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 
1176 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.99 
 
 
1177 aa  439  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.81 
 
 
1176 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 
1187 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 
1176 aa  423  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.99 
 
 
1173 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 
1204 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 
1176 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.93 
 
 
1187 aa  392  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 
1185 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.29 
 
 
1186 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.63 
 
 
1175 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  35.34 
 
 
1162 aa  354  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 
1403 aa  354  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.94 
 
 
1185 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 
1164 aa  347  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.81 
 
 
1186 aa  338  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1179 aa  338  5e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  45.61 
 
 
1195 aa  335  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 
1176 aa  331  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  52.41 
 
 
1164 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  49.24 
 
 
1162 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  34.12 
 
 
1140 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  32.79 
 
 
1144 aa  324  7e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  35.6 
 
 
1165 aa  322  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  36.99 
 
 
1139 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 
1133 aa  308  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  33.48 
 
 
1138 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>