More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1426 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.96 
 
 		 1163 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.51 
 
 		 1167 aa  661    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  39.9 
 
 		 1162 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  75.11 
 
 		 1170 aa  1727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  37.97 
 
 		 1162 aa  695    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 		 1170 aa  1735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.48 
 
 		 1167 aa  660    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  73.82 
 
 		 1202 aa  1697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  75.11 
 
 		 1206 aa  1707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  73.82 
 
 		 1170 aa  1696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  37.88 
 
 		 1162 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.3 
 
 		 1168 aa  720    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  49.79 
 
 		 1167 aa  1035    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  58.86 
 
 		 1181 aa  1279    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  90.95 
 
 		 1171 aa  2138    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  60.98 
 
 		 1175 aa  1349    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  48.82 
 
 		 1165 aa  988    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  37.88 
 
 		 1162 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  73.91 
 
 		 1268 aa  1705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  37.83 
 
 		 1170 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.35 
 
 		 1162 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  74.76 
 
 		 1172 aa  1721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  75.19 
 
 		 1170 aa  1724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  57.72 
 
 		 1175 aa  1261    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  73.99 
 
 		 1170 aa  1700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  59.15 
 
 		 1175 aa  1276    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  58.93 
 
 		 1174 aa  1271    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  46.92 
 
 		 1190 aa  981    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  38.44 
 
 		 1162 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  73.99 
 
 		 1170 aa  1701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  58.69 
 
 		 1171 aa  1272    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.81 
 
 		 1162 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  59.25 
 
 		 1171 aa  1305    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  38.25 
 
 		 1168 aa  718    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  43.15 
 
 		 1168 aa  850    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  58.25 
 
 		 1182 aa  1307    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  74.25 
 
 		 1198 aa  1739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  82.15 
 
 		 1171 aa  1897    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  48.29 
 
 		 1234 aa  968    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.07 
 
 		 1164 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  74.17 
 
 		 1198 aa  1731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1171 aa  2356    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  59.71 
 
 		 1170 aa  1293    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.54 
 
 		 1169 aa  672    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  74.94 
 
 		 1170 aa  1728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  73.82 
 
 		 1200 aa  1697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  35.77 
 
 		 1167 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  82.15 
 
 		 1171 aa  1920    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.97 
 
 		 1167 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.86 
 
 		 1164 aa  646    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  57.4 
 
 		 1204 aa  1240    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  74.67 
 
 		 1142 aa  1668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.55 
 
 		 1162 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  53.41 
 
 		 1152 aa  1117    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  58.76 
 
 		 1174 aa  1255    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  73.99 
 
 		 1170 aa  1700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  75.02 
 
 		 1170 aa  1732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  73.99 
 
 		 1170 aa  1699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  54.51 
 
 		 1173 aa  1180    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.79 
 
 		 1169 aa  673    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  36.85 
 
 		 1145 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1164 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1164 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  38.36 
 
 		 1168 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  36.78 
 
 		 1145 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  36.09 
 
 		 1164 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  36.88 
 
 		 1142 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  36.38 
 
 		 1142 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  38.9 
 
 		 1165 aa  609  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  35.86 
 
 		 1142 aa  611  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  36.63 
 
 		 1139 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 		 1162 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  36.14 
 
 		 1162 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  36.19 
 
 		 1162 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  33.98 
 
 		 1167 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.63 
 
 		 1150 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  33.63 
 
 		 1150 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.99 
 
 		 1176 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1176 aa  466  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.64 
 
 		 1175 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 		 1177 aa  446  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.31 
 
 		 1173 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.86 
 
 		 1187 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.76 
 
 		 1204 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 		 1199 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 		 1403 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 		 1191 aa  389  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28 
 
 		 1185 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.95 
 
 		 1178 aa  379  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1190 aa  380  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.59 
 
 		 1187 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1176 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.93 
 
 		 1184 aa  362  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 		 1190 aa  359  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  36.38 
 
 		 1140 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  33.78 
 
 		 1144 aa  356  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.91 
 
 		 1177 aa  353  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 		 1185 aa  352  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 		 1177 aa  347  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  41.8 
 
 		 1195 aa  346  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>