More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1736 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 814 aa  1628    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  62.97 
 
 		 1133 aa  911    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  48.55 
 
 		 1142 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  53.29 
 
 		 1141 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  48.25 
 
 		 1142 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  48.18 
 
 		 1142 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  48.5 
 
 		 1145 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  50.19 
 
 		 1140 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  45.77 
 
 		 1145 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  49.37 
 
 		 1138 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  48.73 
 
 		 1138 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1138 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  49.86 
 
 		 1138 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  44.26 
 
 		 1139 aa  545  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 		 1144 aa  515  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  43.57 
 
 		 1138 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  41.11 
 
 		 1162 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  37.54 
 
 		 1162 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  37.69 
 
 		 1162 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  40.58 
 
 		 1162 aa  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.24 
 
 		 1162 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.31 
 
 		 1164 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  40.03 
 
 		 1162 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  40.24 
 
 		 1162 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  40.54 
 
 		 1162 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  40.18 
 
 		 1162 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  37.7 
 
 		 1162 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  37.58 
 
 		 1162 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  42.56 
 
 		 1195 aa  379  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  63.93 
 
 		 1163 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.52 
 
 		 1168 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  39.85 
 
 		 1164 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  37.01 
 
 		 1168 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1164 aa  344  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1164 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  38.9 
 
 		 1170 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  36.2 
 
 		 1165 aa  337  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.25 
 
 		 1169 aa  335  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.95 
 
 		 1169 aa  335  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  34.06 
 
 		 1165 aa  323  6e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  35.07 
 
 		 1109 aa  320  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.04 
 
 		 1175 aa  318  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  35.98 
 
 		 1167 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  34.83 
 
 		 1174 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  65.44 
 
 		 1168 aa  314  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  34.73 
 
 		 1175 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  35.46 
 
 		 1171 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  34.54 
 
 		 1170 aa  313  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  36.07 
 
 		 1167 aa  310  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.08 
 
 		 1167 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  67.79 
 
 		 1164 aa  308  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.93 
 
 		 1167 aa  306  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  34.06 
 
 		 1171 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  34.54 
 
 		 1171 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  37.26 
 
 		 1190 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  43.7 
 
 		 1171 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  53.87 
 
 		 1172 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  63.13 
 
 		 1174 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  34.33 
 
 		 1204 aa  303  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  49.58 
 
 		 1198 aa  303  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  49.3 
 
 		 1198 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1268 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1170 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1200 aa  299  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1170 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1170 aa  299  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1202 aa  299  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1170 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  53.7 
 
 		 1167 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  61.11 
 
 		 1234 aa  298  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  46.89 
 
 		 1142 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  46.89 
 
 		 1170 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  48.04 
 
 		 1181 aa  293  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  61.11 
 
 		 1175 aa  293  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  46.61 
 
 		 1206 aa  293  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  47.49 
 
 		 1170 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  32.43 
 
 		 1173 aa  293  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  47.49 
 
 		 1170 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  46.33 
 
 		 1170 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  47.49 
 
 		 1170 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  47.49 
 
 		 1170 aa  291  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  52.59 
 
 		 1171 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  56.07 
 
 		 1171 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 		 1182 aa  289  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  54.17 
 
 		 1152 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 		 1167 aa  269  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  43.26 
 
 		 1199 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  36.68 
 
 		 1176 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  42.95 
 
 		 1199 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  42.95 
 
 		 1199 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  36.82 
 
 		 1176 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  55.71 
 
 		 1150 aa  253  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  55.71 
 
 		 1150 aa  253  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1177 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  42.38 
 
 		 1173 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  54.55 
 
 		 1176 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  41.9 
 
 		 1198 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  41.21 
 
 		 1176 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  39.8 
 
 		 1175 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  45.55 
 
 		 1403 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>