More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2356 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  46.32 
 
 		 1175 aa  923    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  43.49 
 
 		 1176 aa  870    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  100 
 
 		 1173 aa  2329    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  47.48 
 
 		 1176 aa  947    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  37.25 
 
 		 1199 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  37.2 
 
 		 1199 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  37.93 
 
 		 1198 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  44.99 
 
 		 1176 aa  877    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  42.88 
 
 		 1177 aa  834    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  37.28 
 
 		 1199 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  44.91 
 
 		 1176 aa  872    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  45.73 
 
 		 1176 aa  865    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  34.23 
 
 		 1204 aa  601  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 		 1187 aa  592  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  33.11 
 
 		 1187 aa  592  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.67 
 
 		 1190 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.83 
 
 		 1196 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.83 
 
 		 1189 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  34.39 
 
 		 1189 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.44 
 
 		 1189 aa  569  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  33.77 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  33.77 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  33.47 
 
 		 1189 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.61 
 
 		 1189 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  33.77 
 
 		 1189 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.61 
 
 		 1189 aa  559  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.44 
 
 		 1189 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.44 
 
 		 1189 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  35.47 
 
 		 1403 aa  552  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1190 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1185 aa  542  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 		 1191 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.79 
 
 		 1198 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.93 
 
 		 1185 aa  510  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1188 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1188 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 		 1185 aa  503  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  34.11 
 
 		 1167 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 		 1185 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  34.04 
 
 		 1168 aa  496  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 		 1148 aa  494  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.68 
 
 		 1186 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 		 1177 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  34.35 
 
 		 1167 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  34.52 
 
 		 1162 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  32.15 
 
 		 1169 aa  489  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.78 
 
 		 1189 aa  486  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 		 1177 aa  484  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 		 1169 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  31.76 
 
 		 1168 aa  486  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 		 1176 aa  483  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  33.79 
 
 		 1164 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1162 aa  483  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  30.84 
 
 		 1179 aa  479  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.73 
 
 		 1187 aa  472  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.26 
 
 		 1186 aa  472  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1163 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1186 aa  461  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.72 
 
 		 1178 aa  462  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.6 
 
 		 1171 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 		 1171 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 		 1171 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1171 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.23 
 
 		 1174 aa  450  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.39 
 
 		 1184 aa  450  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  30.41 
 
 		 1178 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1172 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  31.22 
 
 		 1165 aa  439  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  31.62 
 
 		 1179 aa  436  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  31.07 
 
 		 1198 aa  436  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  31.83 
 
 		 1190 aa  432  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  31.05 
 
 		 1177 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 		 1268 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  30.9 
 
 		 1173 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.68 
 
 		 1179 aa  425  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.29 
 
 		 1182 aa  426  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 		 1170 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  32 
 
 		 1181 aa  419  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1174 aa  416  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.07 
 
 		 1175 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1174 aa  412  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1194 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 		 1171 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 		 1308 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.72 
 
 		 1191 aa  412  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1150 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1150 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 		 1164 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  31.67 
 
 		 1192 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  31.55 
 
 		 1154 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 		 1170 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 		 1170 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.1 
 
 		 1180 aa  368  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.34 
 
 		 1174 aa  352  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 		 1181 aa  351  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 		 1153 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 		 1301 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1189 aa  282  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 		 1171 aa  266  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  33.44 
 
 		 1255 aa  264  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>