More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0645 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  47.64 
 
 		 1198 aa  978    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  42.94 
 
 		 1204 aa  852    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.09 
 
 		 1168 aa  694    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  43.81 
 
 		 1171 aa  884    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  38.04 
 
 		 1162 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 		 1206 aa  952    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  48.02 
 
 		 1170 aa  971    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  38.27 
 
 		 1162 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  46.76 
 
 		 1167 aa  949    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  38.19 
 
 		 1164 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  43.33 
 
 		 1181 aa  885    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  46.59 
 
 		 1171 aa  982    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 		 1170 aa  960    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  45.42 
 
 		 1165 aa  962    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  43.4 
 
 		 1174 aa  871    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  47.94 
 
 		 1268 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.53 
 
 		 1162 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 		 1170 aa  961    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  47.94 
 
 		 1200 aa  969    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  46.94 
 
 		 1170 aa  953    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  44.13 
 
 		 1175 aa  889    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.61 
 
 		 1169 aa  638    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  48.02 
 
 		 1170 aa  971    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  48.02 
 
 		 1170 aa  971    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1190 aa  2411    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  43.28 
 
 		 1173 aa  854    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  44.64 
 
 		 1234 aa  906    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  48.02 
 
 		 1170 aa  961    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  37.3 
 
 		 1163 aa  666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  43.23 
 
 		 1152 aa  811    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  43.76 
 
 		 1171 aa  901    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.27 
 
 		 1168 aa  692    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.1 
 
 		 1167 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  43.52 
 
 		 1168 aa  828    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 		 1182 aa  868    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  47.48 
 
 		 1198 aa  981    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  37.43 
 
 		 1164 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  37.8 
 
 		 1162 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  46.92 
 
 		 1171 aa  1018    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  46.76 
 
 		 1170 aa  960    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  47.17 
 
 		 1171 aa  1007    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  44.36 
 
 		 1175 aa  899    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.57 
 
 		 1169 aa  647    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  47.18 
 
 		 1171 aa  1014    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  44.28 
 
 		 1175 aa  897    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  47.94 
 
 		 1202 aa  969    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  46.09 
 
 		 1142 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  39.57 
 
 		 1162 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  39.44 
 
 		 1162 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  43.95 
 
 		 1170 aa  891    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 		 1170 aa  962    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  39.82 
 
 		 1162 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  43.27 
 
 		 1174 aa  869    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  47.3 
 
 		 1172 aa  979    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  48.02 
 
 		 1170 aa  971    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  35.9 
 
 		 1167 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.9 
 
 		 1167 aa  629  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  36.93 
 
 		 1140 aa  629  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  37.22 
 
 		 1162 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  36.64 
 
 		 1167 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  35.26 
 
 		 1164 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  36.7 
 
 		 1141 aa  598  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  35.8 
 
 		 1133 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1164 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1164 aa  588  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1177 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 		 1176 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.1 
 
 		 1175 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 		 1187 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.89 
 
 		 1173 aa  428  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.29 
 
 		 1199 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1199 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1199 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.35 
 
 		 1190 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.86 
 
 		 1190 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 		 1185 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 		 1191 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  38.21 
 
 		 1168 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 		 1148 aa  375  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.53 
 
 		 1185 aa  361  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.66 
 
 		 1187 aa  356  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.74 
 
 		 1184 aa  355  2.9999999999999997e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.2 
 
 		 1178 aa  352  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  41.56 
 
 		 1142 aa  347  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  35.57 
 
 		 1170 aa  347  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  40.39 
 
 		 1142 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  41.03 
 
 		 1142 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  41.34 
 
 		 1145 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.86 
 
 		 1177 aa  343  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  39.04 
 
 		 1144 aa  341  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  50.46 
 
 		 1195 aa  340  8e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  43.57 
 
 		 1162 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  34.48 
 
 		 1138 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  54.05 
 
 		 1162 aa  337  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  40.57 
 
 		 1145 aa  336  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  54.05 
 
 		 1162 aa  336  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  40.07 
 
 		 1138 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  40.18 
 
 		 1138 aa  335  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1138 aa  334  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  39.82 
 
 		 1138 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>