More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1346 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  58.62 
 
 
1175 aa  1292    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  38.93 
 
 
1162 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  37 
 
 
1167 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  74.94 
 
 
1171 aa  1718    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  39.93 
 
 
1162 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  88.46 
 
 
1170 aa  2012    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  88.21 
 
 
1170 aa  1988    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  39.85 
 
 
1162 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  50.64 
 
 
1167 aa  1038    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  48.76 
 
 
1234 aa  975    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  76.56 
 
 
1171 aa  1776    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  57.11 
 
 
1175 aa  1224    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  48.95 
 
 
1165 aa  966    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  58.25 
 
 
1174 aa  1234    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.26 
 
 
1162 aa  712    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  88.29 
 
 
1268 aa  1996    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  39.3 
 
 
1170 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  40.36 
 
 
1162 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  88.03 
 
 
1206 aa  1979    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  88.55 
 
 
1170 aa  2009    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  40.23 
 
 
1162 aa  688    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  57.99 
 
 
1174 aa  1241    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  88.21 
 
 
1202 aa  1987    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  52.03 
 
 
1152 aa  1085    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  58.34 
 
 
1175 aa  1235    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  58.97 
 
 
1181 aa  1264    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  47.51 
 
 
1190 aa  966    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  75.11 
 
 
1171 aa  1744    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1172 aa  2345    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  88.8 
 
 
1170 aa  2009    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  88.21 
 
 
1170 aa  1989    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  58.29 
 
 
1171 aa  1262    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.97 
 
 
1168 aa  705    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.1 
 
 
1169 aa  660    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  44.32 
 
 
1168 aa  847    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  57.61 
 
 
1182 aa  1283    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  91.21 
 
 
1198 aa  2114    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.85 
 
 
1164 aa  690    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  90.96 
 
 
1198 aa  2099    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  74.76 
 
 
1171 aa  1774    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.99 
 
 
1167 aa  648    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  40.53 
 
 
1162 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  88.55 
 
 
1170 aa  2011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  88.38 
 
 
1170 aa  1992    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  88.21 
 
 
1200 aa  1987    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  38.81 
 
 
1167 aa  665    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  56.55 
 
 
1204 aa  1204    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.48 
 
 
1168 aa  695    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  39.41 
 
 
1163 aa  689    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  59.17 
 
 
1171 aa  1269    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  88.29 
 
 
1170 aa  1991    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  88.35 
 
 
1142 aa  1946    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  40.4 
 
 
1162 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  88.72 
 
 
1170 aa  2012    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.26 
 
 
1169 aa  661    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  88.63 
 
 
1170 aa  2013    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  37.59 
 
 
1167 aa  676    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  53.14 
 
 
1173 aa  1145    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  58.75 
 
 
1170 aa  1257    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  38.93 
 
 
1164 aa  632  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.68 
 
 
1164 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.59 
 
 
1195 aa  627  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  36.51 
 
 
1164 aa  622  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  36.49 
 
 
1164 aa  622  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  38.03 
 
 
1142 aa  616  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  36.61 
 
 
1133 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  35.62 
 
 
1139 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  37.63 
 
 
1141 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.66 
 
 
1150 aa  486  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  34.66 
 
 
1150 aa  486  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.07 
 
 
1167 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.13 
 
 
1176 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.83 
 
 
1177 aa  466  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.11 
 
 
1176 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.08 
 
 
1175 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.84 
 
 
1199 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.52 
 
 
1173 aa  439  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 
1204 aa  439  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.44 
 
 
1199 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.36 
 
 
1199 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 
1187 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.28 
 
 
1190 aa  406  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  38.81 
 
 
1162 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  39.09 
 
 
1162 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 
1190 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  38.53 
 
 
1162 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.84 
 
 
1189 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.17 
 
 
1196 aa  386  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.87 
 
 
1185 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 
1403 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.36 
 
 
1189 aa  383  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.89 
 
 
1187 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.65 
 
 
1191 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  40.78 
 
 
1168 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 
1186 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.9 
 
 
1176 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.29 
 
 
1185 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.86 
 
 
1184 aa  358  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29 
 
 
1179 aa  357  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.34 
 
 
1177 aa  352  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>