More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0800 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  100 
 
 		 1189 aa  2402    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  41.45 
 
 		 1189 aa  870    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  37.47 
 
 		 1179 aa  700    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  41.42 
 
 		 1189 aa  870    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 		 1189 aa  869    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  36.71 
 
 		 1187 aa  691    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  41.26 
 
 		 1189 aa  867    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  41.78 
 
 		 1189 aa  867    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  36.4 
 
 		 1198 aa  640    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  41.45 
 
 		 1189 aa  870    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  41.42 
 
 		 1189 aa  870    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  76.26 
 
 		 1188 aa  1847    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 		 1189 aa  867    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  41.32 
 
 		 1189 aa  880    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  43.34 
 
 		 1187 aa  914    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  76.26 
 
 		 1188 aa  1847    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  41.42 
 
 		 1189 aa  883    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  42.28 
 
 		 1187 aa  841    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  41.49 
 
 		 1189 aa  870    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  34.35 
 
 		 1174 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  35.7 
 
 		 1186 aa  658    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  35.28 
 
 		 1185 aa  665    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  37.56 
 
 		 1177 aa  672    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  34.35 
 
 		 1185 aa  635  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  34 
 
 		 1190 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1196 aa  617  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1190 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.31 
 
 		 1186 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  33.55 
 
 		 1191 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.79 
 
 		 1187 aa  581  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  34.4 
 
 		 1184 aa  580  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1185 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1177 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.54 
 
 		 1176 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.9 
 
 		 1175 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  29.83 
 
 		 1191 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1176 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 		 1176 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 		 1176 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.83 
 
 		 1173 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 		 1176 aa  479  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 		 1181 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  29.44 
 
 		 1172 aa  466  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1204 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 		 1175 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1164 aa  429  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.77 
 
 		 1180 aa  421  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  28.29 
 
 		 1167 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1167 aa  423  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.38 
 
 		 1174 aa  420  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 		 1170 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 		 1170 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 		 1167 aa  410  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1169 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1186 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.03 
 
 		 1169 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.78 
 
 		 1178 aa  400  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28 
 
 		 1185 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  27.51 
 
 		 1168 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 		 1167 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 		 1178 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1403 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.06 
 
 		 1134 aa  379  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.43 
 
 		 1184 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  27.58 
 
 		 1153 aa  360  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.72 
 
 		 1174 aa  353  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.42 
 
 		 1189 aa  351  6e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.12 
 
 		 1189 aa  350  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.98 
 
 		 1174 aa  348  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1193 aa  341  5e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 		 1191 aa  340  7e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.8 
 
 		 1171 aa  337  1e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  27.3 
 
 		 1188 aa  335  3e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  27.38 
 
 		 1082 aa  332  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 		 1189 aa  327  8.000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.83 
 
 		 1308 aa  326  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  31.85 
 
 		 978 aa  315  3.9999999999999997e-84  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  25.34 
 
 		 1196 aa  314  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.55 
 
 		 1192 aa  310  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.06 
 
 		 1175 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  23.61 
 
 		 1146 aa  296  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.92 
 
 		 1226 aa  294  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1226 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  46.37 
 
 		 1190 aa  293  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 		 1190 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.22 
 
 		 1147 aa  291  7e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.52 
 
 		 1146 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  54.27 
 
 		 1185 aa  284  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  53.42 
 
 		 1185 aa  280  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  24.48 
 
 		 1146 aa  280  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.66 
 
 		 1219 aa  279  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1177 aa  277  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  24.57 
 
 		 1208 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.54 
 
 		 1217 aa  268  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 		 1185 aa  268  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 		 1224 aa  263  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 		 1301 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.16 
 
 		 1194 aa  254  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  28.16 
 
 		 1205 aa  254  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>