More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1130 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  100 
 
 		 1175 aa  2328    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  41.04 
 
 		 1199 aa  721    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  49.92 
 
 		 1177 aa  1046    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  40.95 
 
 		 1199 aa  720    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  46.32 
 
 		 1173 aa  895    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  37.27 
 
 		 1403 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  72.9 
 
 		 1176 aa  1680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  41.06 
 
 		 1199 aa  725    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  57.45 
 
 		 1176 aa  1229    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  58.93 
 
 		 1176 aa  1327    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  57.53 
 
 		 1176 aa  1244    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  41.21 
 
 		 1198 aa  724    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  53.26 
 
 		 1176 aa  1081    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  35.65 
 
 		 1204 aa  629  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  34.14 
 
 		 1187 aa  612  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.77 
 
 		 1189 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.91 
 
 		 1190 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.14 
 
 		 1189 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 		 1190 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.8 
 
 		 1187 aa  576  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 		 1189 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.66 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.66 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1196 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  33.58 
 
 		 1189 aa  563  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  33.58 
 
 		 1189 aa  563  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.74 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  33.52 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.74 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 		 1189 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 		 1185 aa  555  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.44 
 
 		 1198 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 		 1188 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 		 1188 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  33.69 
 
 		 1167 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  34.67 
 
 		 1168 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  32.71 
 
 		 1177 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 		 1191 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  31.45 
 
 		 1185 aa  512  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 		 1185 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.94 
 
 		 1186 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  31.91 
 
 		 1178 aa  502  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  33.22 
 
 		 1167 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  34.82 
 
 		 1163 aa  499  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.26 
 
 		 1178 aa  498  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  33.83 
 
 		 1162 aa  499  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.63 
 
 		 1167 aa  495  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  32.46 
 
 		 1168 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 		 1185 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.63 
 
 		 1167 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  32.98 
 
 		 1162 aa  492  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  32.41 
 
 		 1173 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.21 
 
 		 1186 aa  491  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.82 
 
 		 1186 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.13 
 
 		 1162 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.57 
 
 		 1187 aa  480  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 		 1164 aa  482  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.44 
 
 		 1162 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  30.57 
 
 		 1179 aa  479  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 		 1177 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 		 1164 aa  476  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1164 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.45 
 
 		 1169 aa  466  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 		 1176 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 		 1148 aa  462  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.62 
 
 		 1174 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.64 
 
 		 1171 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  32.17 
 
 		 1152 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.27 
 
 		 1171 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1198 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.54 
 
 		 1165 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 		 1170 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 		 1179 aa  448  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1170 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1170 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 		 1171 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1170 aa  446  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  32.2 
 
 		 1308 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 		 1198 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1170 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.39 
 
 		 1175 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  31.87 
 
 		 1206 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  31.94 
 
 		 1268 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.67 
 
 		 1175 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  31.66 
 
 		 1194 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  31.84 
 
 		 1174 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 		 1181 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 		 1204 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  31.03 
 
 		 1170 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 		 1142 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.32 
 
 		 1179 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  31.56 
 
 		 1174 aa  413  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.98 
 
 		 1177 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.76 
 
 		 1191 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.65 
 
 		 1172 aa  395  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 		 1170 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 		 1174 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1164 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.1 
 
 		 1174 aa  379  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1170 aa  379  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>