More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2192 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  46.41 
 
 		 1170 aa  900    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  49.1 
 
 		 1170 aa  984    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  41.71 
 
 		 1152 aa  790    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  49.23 
 
 		 1202 aa  989    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  49.3 
 
 		 1170 aa  984    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  51.4 
 
 		 1167 aa  1043    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  43.08 
 
 		 1173 aa  844    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  47.74 
 
 		 1171 aa  981    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  46.15 
 
 		 1175 aa  928    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  45.74 
 
 		 1165 aa  884    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  48.76 
 
 		 1172 aa  977    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  45.95 
 
 		 1174 aa  888    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  49.35 
 
 		 1268 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  48.77 
 
 		 1170 aa  982    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  45.08 
 
 		 1175 aa  880    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  40.18 
 
 		 1162 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  49.23 
 
 		 1200 aa  990    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  45.37 
 
 		 1190 aa  916    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  49.01 
 
 		 1170 aa  980    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  46.75 
 
 		 1181 aa  907    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  44.36 
 
 		 1171 aa  898    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  36.92 
 
 		 1168 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  43.27 
 
 		 1168 aa  805    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  45.18 
 
 		 1182 aa  904    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  49.07 
 
 		 1198 aa  1003    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  45.06 
 
 		 1175 aa  882    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  48.58 
 
 		 1198 aa  990    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  45.62 
 
 		 1174 aa  882    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  48.29 
 
 		 1171 aa  1005    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  48.85 
 
 		 1170 aa  980    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  49.38 
 
 		 1170 aa  987    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1171 aa  901    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  47.66 
 
 		 1171 aa  982    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1234 aa  2406    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  48.9 
 
 		 1206 aa  976    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  47.79 
 
 		 1171 aa  974    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.27 
 
 		 1162 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  48.57 
 
 		 1142 aa  942    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.2 
 
 		 1162 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  44.2 
 
 		 1204 aa  871    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  49.26 
 
 		 1170 aa  990    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  49.3 
 
 		 1170 aa  986    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  48.93 
 
 		 1170 aa  983    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.34 
 
 		 1168 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  49.3 
 
 		 1170 aa  986    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.84 
 
 		 1169 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  35.75 
 
 		 1169 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  38.25 
 
 		 1162 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.93 
 
 		 1167 aa  617  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  37.4 
 
 		 1167 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  37.5 
 
 		 1167 aa  609  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1164 aa  598  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  33.73 
 
 		 1195 aa  592  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1164 aa  589  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.39 
 
 		 1167 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  36.89 
 
 		 1170 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1176 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.52 
 
 		 1176 aa  465  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.72 
 
 		 1176 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  32.96 
 
 		 1176 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.48 
 
 		 1175 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  33.76 
 
 		 1177 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.88 
 
 		 1173 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1187 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.36 
 
 		 1189 aa  399  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.72 
 
 		 1190 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.77 
 
 		 1189 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 		 1186 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.94 
 
 		 1190 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.42 
 
 		 1187 aa  368  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 		 1185 aa  362  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  40.64 
 
 		 1164 aa  356  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 		 1403 aa  348  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.46 
 
 		 1178 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1170 aa  342  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  39.89 
 
 		 1140 aa  340  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1170 aa  335  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  52.05 
 
 		 1162 aa  335  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  50.63 
 
 		 1162 aa  334  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  50.63 
 
 		 1162 aa  334  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  50.9 
 
 		 1139 aa  329  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1177 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  54.18 
 
 		 1163 aa  326  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  37.67 
 
 		 1145 aa  324  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  50.66 
 
 		 1144 aa  323  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  39.62 
 
 		 1142 aa  322  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  53.14 
 
 		 1168 aa  322  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  37.65 
 
 		 1145 aa  322  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  50.49 
 
 		 1164 aa  320  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 		 1138 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 		 1138 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 		 1138 aa  317  9e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  37.96 
 
 		 1133 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  48.49 
 
 		 1138 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  37.46 
 
 		 1138 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  35.79 
 
 		 1162 aa  314  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  54.14 
 
 		 1162 aa  312  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  47.29 
 
 		 1141 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  36.28 
 
 		 1165 aa  308  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  51.37 
 
 		 1162 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>