More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2049 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  46.2 
 
 		 1162 aa  878    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  45.95 
 
 		 1162 aa  890    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  39.91 
 
 		 1109 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  46.6 
 
 		 1162 aa  893    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  38.54 
 
 		 1145 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  45.32 
 
 		 1162 aa  895    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  46.02 
 
 		 1162 aa  885    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  46.49 
 
 		 1162 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1164 aa  688    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  37.48 
 
 		 1164 aa  679    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  45.64 
 
 		 1162 aa  884    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  36.74 
 
 		 1195 aa  689    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  38.8 
 
 		 1167 aa  651    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  36.95 
 
 		 1171 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  36.54 
 
 		 1171 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  38.9 
 
 		 1165 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  42.58 
 
 		 1164 aa  783    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  43.83 
 
 		 1170 aa  820    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  44.42 
 
 		 1162 aa  868    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  48.28 
 
 		 1168 aa  991    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  38.13 
 
 		 1139 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  40.36 
 
 		 1169 aa  806    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1163 aa  900    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  46.11 
 
 		 1162 aa  876    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1167 aa  2340    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  47.45 
 
 		 1162 aa  943    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  43.41 
 
 		 1168 aa  912    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  43.11 
 
 		 1164 aa  786    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  37.46 
 
 		 1171 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  75.49 
 
 		 1167 aa  1727    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  36.51 
 
 		 1171 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  99.66 
 
 		 1167 aa  2333    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  37.35 
 
 		 1164 aa  702    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  40.71 
 
 		 1169 aa  810    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  38.55 
 
 		 1142 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  45.18 
 
 		 1168 aa  809    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  47.7 
 
 		 1162 aa  946    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  78.93 
 
 		 1167 aa  1830    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  37.83 
 
 		 1142 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  45.78 
 
 		 1165 aa  818    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  36.53 
 
 		 1140 aa  634  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  36.74 
 
 		 1172 aa  632  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 		 1198 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  36.55 
 
 		 1198 aa  632  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  36.26 
 
 		 1133 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  36.07 
 
 		 1175 aa  622  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  36.79 
 
 		 1170 aa  622  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  36.57 
 
 		 1170 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  36.51 
 
 		 1170 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  36.49 
 
 		 1170 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  36.13 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  36.49 
 
 		 1170 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  36.21 
 
 		 1170 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  36.76 
 
 		 1206 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  36.8 
 
 		 1204 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  36.69 
 
 		 1174 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  35.9 
 
 		 1190 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  35.45 
 
 		 1141 aa  606  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.15 
 
 		 1182 aa  602  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  36.53 
 
 		 1174 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  36.01 
 
 		 1175 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  36.22 
 
 		 1175 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  36.69 
 
 		 1168 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  35.81 
 
 		 1181 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  35.47 
 
 		 1171 aa  581  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  35.93 
 
 		 1142 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 		 1167 aa  522  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.82 
 
 		 1176 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.63 
 
 		 1175 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.74 
 
 		 1176 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.42 
 
 		 1177 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.12 
 
 		 1150 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 		 1150 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  34.12 
 
 		 1199 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.81 
 
 		 1199 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1199 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1187 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.04 
 
 		 1188 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1185 aa  432  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.04 
 
 		 1188 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1204 aa  429  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.23 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 		 1187 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27 
 
 		 1190 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.41 
 
 		 1189 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.22 
 
 		 1191 aa  399  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.63 
 
 		 1190 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.18 
 
 		 1148 aa  394  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 		 1186 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.19 
 
 		 1187 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 		 1176 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  38.98 
 
 		 1142 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  27.26 
 
 		 1186 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 		 1151 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.72 
 
 		 1178 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1185 aa  365  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  50.14 
 
 		 1138 aa  363  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  50.14 
 
 		 1138 aa  363  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  51.01 
 
 		 1138 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  37.7 
 
 		 1268 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>