More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1879 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  38.88 
 
 		 1138 aa  740    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  58.05 
 
 		 1162 aa  1219    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  58.58 
 
 		 1162 aa  1242    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  44.55 
 
 		 1169 aa  940    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  39.45 
 
 		 1109 aa  705    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  58.68 
 
 		 1162 aa  1270    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  57.5 
 
 		 1162 aa  1209    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  39.18 
 
 		 1145 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  58.39 
 
 		 1162 aa  1261    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 		 1170 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  37.82 
 
 		 1173 aa  694    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  40.47 
 
 		 1133 aa  726    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  39.43 
 
 		 1138 aa  747    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1164 aa  776    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  38.92 
 
 		 1164 aa  779    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  58.23 
 
 		 1162 aa  1253    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  38.84 
 
 		 1198 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  39.11 
 
 		 1167 aa  703    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  37.64 
 
 		 1175 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  38.26 
 
 		 1171 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  37.01 
 
 		 1152 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  38.14 
 
 		 1165 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  37.58 
 
 		 1174 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  38.55 
 
 		 1268 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  47.32 
 
 		 1170 aa  988    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  57.9 
 
 		 1162 aa  1233    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  38.96 
 
 		 1138 aa  739    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  53.56 
 
 		 1163 aa  1108    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  57.42 
 
 		 1162 aa  1214    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  37.67 
 
 		 1175 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  37.16 
 
 		 1190 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  44.55 
 
 		 1169 aa  947    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  40.61 
 
 		 1195 aa  803    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1181 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  37.85 
 
 		 1171 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1168 aa  2358    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  34.38 
 
 		 1168 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  37.89 
 
 		 1182 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  38.86 
 
 		 1198 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  39.41 
 
 		 1138 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  39.65 
 
 		 1145 aa  736    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  47.03 
 
 		 1164 aa  946    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  38.5 
 
 		 1171 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  45.08 
 
 		 1165 aa  863    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  38.27 
 
 		 1171 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  43.46 
 
 		 1167 aa  923    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  38.69 
 
 		 1170 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  37.15 
 
 		 1175 aa  675    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 		 1234 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  42.36 
 
 		 1164 aa  831    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  45.21 
 
 		 1167 aa  955    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 		 1167 aa  962    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  43.29 
 
 		 1167 aa  919    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  57.88 
 
 		 1162 aa  1220    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  38.12 
 
 		 1170 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  39.82 
 
 		 1142 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  39.33 
 
 		 1142 aa  736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  45.42 
 
 		 1168 aa  888    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1174 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  58.68 
 
 		 1162 aa  1272    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  39.04 
 
 		 1138 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  38.92 
 
 		 1140 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  38.69 
 
 		 1170 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  37.91 
 
 		 1172 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  39.05 
 
 		 1142 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  57.12 
 
 		 1162 aa  1219    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  38.69 
 
 		 1170 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  50.21 
 
 		 1168 aa  1066    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  41.19 
 
 		 1164 aa  794    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  37.78 
 
 		 1171 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  40.1 
 
 		 1139 aa  729    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1150 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1150 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.58 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.79 
 
 		 1176 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1167 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1177 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.43 
 
 		 1175 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.79 
 
 		 1176 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 		 1176 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.66 
 
 		 1173 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.36 
 
 		 1199 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.44 
 
 		 1199 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.68 
 
 		 1199 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 		 1204 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1187 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 		 1185 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 		 1185 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 		 1191 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1196 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 		 1148 aa  421  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.3 
 
 		 1189 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.97 
 
 		 1189 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.97 
 
 		 1189 aa  410  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.08 
 
 		 1184 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.81 
 
 		 1189 aa  406  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.73 
 
 		 1189 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.81 
 
 		 1189 aa  406  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 		 1188 aa  402  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>