More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0161 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1167 aa  2307    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  35.67 
 
 
1168 aa  572  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  36.52 
 
 
1162 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  36.6 
 
 
1164 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  36.22 
 
 
1162 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.16 
 
 
1167 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  33.8 
 
 
1164 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.04 
 
 
1167 aa  556  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.08 
 
 
1167 aa  555  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  34.22 
 
 
1164 aa  552  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  33.73 
 
 
1169 aa  549  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  33.55 
 
 
1164 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  33.68 
 
 
1169 aa  549  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  35.46 
 
 
1139 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  35.49 
 
 
1162 aa  533  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  34.27 
 
 
1171 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  34.11 
 
 
1171 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  35.47 
 
 
1167 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  34.57 
 
 
1170 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 
1150 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 
1171 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  33.77 
 
 
1175 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 
1150 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 
1268 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  34.91 
 
 
1170 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  34.18 
 
 
1172 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  34.98 
 
 
1170 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  34.98 
 
 
1170 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 
1198 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  31.49 
 
 
1318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.08 
 
 
1175 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.89 
 
 
1176 aa  416  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 
1177 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 
1186 aa  345  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.39 
 
 
1179 aa  337  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 
1403 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1179 aa  326  2e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  34.76 
 
 
1142 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  34.06 
 
 
1142 aa  300  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  34.18 
 
 
1145 aa  299  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  52.83 
 
 
1195 aa  299  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  49.03 
 
 
1170 aa  298  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 
1142 aa  297  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 
1162 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  46.45 
 
 
1162 aa  296  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  34.19 
 
 
1140 aa  295  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  46.67 
 
 
1162 aa  294  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 
1162 aa  294  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 
1162 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  57.02 
 
 
1162 aa  293  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  57.02 
 
 
1162 aa  293  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  47.26 
 
 
1165 aa  289  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  34.72 
 
 
1198 aa  287  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 
1182 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  55.95 
 
 
1138 aa  282  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  55.95 
 
 
1138 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  55.95 
 
 
1138 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  55.95 
 
 
1138 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  33.62 
 
 
1174 aa  281  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  47.78 
 
 
1163 aa  281  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  56.64 
 
 
1162 aa  281  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  49.63 
 
 
1145 aa  280  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  48.87 
 
 
1165 aa  278  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  55.51 
 
 
1133 aa  277  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  56.58 
 
 
1141 aa  277  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 
814 aa  277  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  42.74 
 
 
1174 aa  277  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  37.24 
 
 
1234 aa  277  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 
1138 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  56.56 
 
 
1170 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  56.56 
 
 
1170 aa  274  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  56.56 
 
 
1170 aa  274  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  47.15 
 
 
1170 aa  274  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  56.56 
 
 
1170 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  56.56 
 
 
1170 aa  274  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  56.56 
 
 
1170 aa  274  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  55.86 
 
 
1171 aa  273  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  55.31 
 
 
1144 aa  274  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  55.86 
 
 
1171 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  55.61 
 
 
1175 aa  272  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  53.51 
 
 
1173 aa  273  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  56.11 
 
 
1200 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  48.87 
 
 
1168 aa  273  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  43.3 
 
 
1167 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  56.11 
 
 
1202 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 
1181 aa  271  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  32.77 
 
 
1168 aa  270  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  54.3 
 
 
1171 aa  269  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  55.66 
 
 
1206 aa  269  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  42.35 
 
 
1175 aa  269  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  48.41 
 
 
299 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  42.72 
 
 
1280 aa  267  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  56.31 
 
 
1168 aa  266  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  53.57 
 
 
1204 aa  266  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  55.07 
 
 
1164 aa  265  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  36.58 
 
 
1307 aa  265  4.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  58.04 
 
 
1190 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  55.61 
 
 
1109 aa  256  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  54.11 
 
 
1152 aa  249  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  57.51 
 
 
1142 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>