More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0454 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  35.71 
 
 
1189 aa  659    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  36.15 
 
 
1189 aa  661    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  35.53 
 
 
1189 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  36.06 
 
 
1189 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  36.06 
 
 
1189 aa  658    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  36.1 
 
 
1189 aa  659    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  35.98 
 
 
1189 aa  668    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  36.06 
 
 
1189 aa  658    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.03 
 
 
1187 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  36.33 
 
 
1189 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  36.74 
 
 
1189 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  36.47 
 
 
1187 aa  673    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  36.15 
 
 
1189 aa  661    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  39.5 
 
 
1187 aa  721    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  100 
 
 
1184 aa  2353    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  41.14 
 
 
1185 aa  819    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  36.15 
 
 
1174 aa  635  1e-180  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  34.14 
 
 
1188 aa  632  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  34.14 
 
 
1188 aa  632  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  36.67 
 
 
1179 aa  618  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  35.15 
 
 
1190 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  34.31 
 
 
1189 aa  602  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  34.86 
 
 
1177 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  35.25 
 
 
1186 aa  598  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  34.97 
 
 
1190 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 
1196 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 
1185 aa  579  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  34.2 
 
 
1191 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.07 
 
 
1198 aa  572  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 
1185 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 
1186 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 
1176 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 
1176 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.39 
 
 
1176 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  29.69 
 
 
1199 aa  476  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  30.48 
 
 
1191 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.72 
 
 
1175 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 
1204 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 
1177 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 
1176 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 
1199 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.56 
 
 
1173 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 
1199 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 
1177 aa  465  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 
1185 aa  453  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  29.88 
 
 
1172 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 
1148 aa  436  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 
1170 aa  436  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.97 
 
 
1169 aa  435  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  30.42 
 
 
1180 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.05 
 
 
1169 aa  435  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 
1170 aa  436  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1181 aa  429  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.75 
 
 
1168 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 
1186 aa  429  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 
1179 aa  420  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 
1167 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.93 
 
 
1178 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 
1164 aa  416  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 
1185 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 
1162 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  30.84 
 
 
1178 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 
1167 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 
1164 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.06 
 
 
1162 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  27.35 
 
 
1168 aa  399  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.53 
 
 
1162 aa  396  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 
1177 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 
1179 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.73 
 
 
1171 aa  389  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  29.95 
 
 
1164 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.19 
 
 
1164 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  28.14 
 
 
1200 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 
1171 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 
1164 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  32.05 
 
 
1190 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  28.29 
 
 
1175 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 
1174 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  28.76 
 
 
1174 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 
1184 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1172 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 
1167 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 
1198 aa  365  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 
1170 aa  365  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 
1171 aa  364  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 
1268 aa  364  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 
1153 aa  363  8e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 
1170 aa  363  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  28.76 
 
 
1170 aa  363  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 
1403 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 
1190 aa  362  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 
1200 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 
1202 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.12 
 
 
1174 aa  357  6.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.59 
 
 
1187 aa  344  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  27.85 
 
 
1168 aa  343  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  27.09 
 
 
1175 aa  337  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1308 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.58 
 
 
1134 aa  319  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  31.27 
 
 
1175 aa  316  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>