More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2638 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1308 aa  2661    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32 
 
 
1176 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.29 
 
 
1175 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.07 
 
 
1199 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.16 
 
 
1199 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 
1176 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.9 
 
 
1199 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.13 
 
 
1176 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 
1198 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 
1176 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.32 
 
 
1177 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.7 
 
 
1173 aa  406  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 
1190 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 
1403 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 
1187 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.79 
 
 
1190 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 
1189 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.49 
 
 
1189 aa  366  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.75 
 
 
1178 aa  365  3e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.32 
 
 
1189 aa  362  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 
1189 aa  361  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 
1189 aa  361  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 
1189 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 
1189 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.39 
 
 
1189 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.91 
 
 
1189 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.2 
 
 
1189 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.84 
 
 
1179 aa  358  5e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.39 
 
 
1189 aa  358  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  30.06 
 
 
1168 aa  358  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.55 
 
 
1204 aa  356  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 
1185 aa  356  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  29.62 
 
 
1195 aa  353  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.85 
 
 
1196 aa  352  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 
1167 aa  349  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 
1185 aa  347  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 
1185 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 
1188 aa  340  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 
1188 aa  340  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 
1255 aa  339  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 
1167 aa  339  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  28.84 
 
 
1162 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 
1176 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.02 
 
 
1168 aa  335  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 
1167 aa  335  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 
1191 aa  330  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.83 
 
 
1189 aa  328  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 
1186 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 
1198 aa  324  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.67 
 
 
1187 aa  323  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 
1179 aa  318  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1178 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.08 
 
 
1184 aa  313  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  29.6 
 
 
1175 aa  311  6.999999999999999e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.66 
 
 
1177 aa  310  9e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.77 
 
 
1174 aa  310  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.76 
 
 
1186 aa  305  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 
1148 aa  303  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.9 
 
 
1177 aa  302  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1182 aa  301  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 
1181 aa  299  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.33 
 
 
1186 aa  295  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1174 aa  293  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 
1179 aa  289  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.26 
 
 
1177 aa  263  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  30.2 
 
 
1176 aa  261  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.79 
 
 
1174 aa  258  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  26.68 
 
 
1201 aa  255  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 
1164 aa  252  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.81 
 
 
1170 aa  251  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.11 
 
 
1170 aa  251  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.74 
 
 
1191 aa  250  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  35.98 
 
 
1164 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 
1226 aa  237  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.54 
 
 
1226 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.44 
 
 
1153 aa  234  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 
1185 aa  233  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 
1181 aa  231  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  35.53 
 
 
1164 aa  231  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  36.94 
 
 
1162 aa  229  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25 
 
 
1134 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  32.93 
 
 
1162 aa  224  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  50.51 
 
 
1109 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  39.38 
 
 
1169 aa  223  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  39.06 
 
 
1169 aa  221  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  46.92 
 
 
1301 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 
1141 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  32.44 
 
 
1190 aa  217  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 
1162 aa  217  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 
1172 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  45.7 
 
 
1142 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  39.41 
 
 
1192 aa  217  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  46.7 
 
 
1167 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  48.78 
 
 
1187 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  39.42 
 
 
1163 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  45.7 
 
 
1142 aa  217  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  45.12 
 
 
1168 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.35 
 
 
1185 aa  216  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  46.97 
 
 
1165 aa  216  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  45.25 
 
 
1142 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>