More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0661 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  100 
 
 
1172 aa  2279    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.38 
 
 
1190 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 
1190 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 
1188 aa  492  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 
1188 aa  492  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 
1187 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  33.01 
 
 
1196 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 
1185 aa  475  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.52 
 
 
1189 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 
1185 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1189 aa  465  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.45 
 
 
1187 aa  459  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.92 
 
 
1186 aa  456  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 
1191 aa  442  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.33 
 
 
1174 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 
1177 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  27.48 
 
 
1176 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.28 
 
 
1184 aa  418  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.13 
 
 
1179 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.74 
 
 
1199 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  28.64 
 
 
1176 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  27.88 
 
 
1175 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  26.21 
 
 
1173 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 
1177 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 
1164 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  26.53 
 
 
1172 aa  357  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 
1170 aa  347  8e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.8 
 
 
1185 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 
1179 aa  332  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  24.73 
 
 
1150 aa  330  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 
1167 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 
1150 aa  327  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 
1153 aa  324  5e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.81 
 
 
1174 aa  322  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.31 
 
 
1187 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.98 
 
 
1198 aa  312  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.05 
 
 
1189 aa  309  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.72 
 
 
1189 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 
1184 aa  302  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.96 
 
 
1189 aa  301  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.43 
 
 
1186 aa  301  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.57 
 
 
1134 aa  300  9e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.07 
 
 
1185 aa  297  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  34.02 
 
 
1175 aa  291  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.16 
 
 
1189 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.1 
 
 
1175 aa  278  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 
1189 aa  277  7e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.81 
 
 
1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  27.63 
 
 
1082 aa  275  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 
1146 aa  272  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 
1146 aa  249  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.27 
 
 
1191 aa  247  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 
1146 aa  241  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 
1190 aa  237  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.16 
 
 
1219 aa  237  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  57.98 
 
 
1185 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  57.98 
 
 
1185 aa  234  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.51 
 
 
1255 aa  231  8e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  54.69 
 
 
980 aa  230  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 
1147 aa  230  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  55.25 
 
 
1301 aa  230  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 
1199 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 
1199 aa  228  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  51.6 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  51.6 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  51.06 
 
 
1189 aa  226  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  51.06 
 
 
1189 aa  226  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  51.06 
 
 
1189 aa  226  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  51.06 
 
 
1189 aa  226  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  51.06 
 
 
1189 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  51.06 
 
 
1187 aa  225  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  51.06 
 
 
1148 aa  222  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  53.97 
 
 
1188 aa  222  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  53.19 
 
 
1194 aa  221  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  52.66 
 
 
1194 aa  221  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  52.13 
 
 
1217 aa  219  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  52.66 
 
 
1205 aa  220  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  53.19 
 
 
1081 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1177 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.94 
 
 
1194 aa  218  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  52.2 
 
 
1180 aa  218  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  52.13 
 
 
1195 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  52.13 
 
 
1195 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  52.13 
 
 
1195 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.08 
 
 
1207 aa  216  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  52.13 
 
 
1194 aa  214  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  50.53 
 
 
1198 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  50.53 
 
 
1214 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  51.06 
 
 
1227 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  50.53 
 
 
1198 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  45.71 
 
 
1203 aa  213  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  48.06 
 
 
1217 aa  212  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  50.53 
 
 
1234 aa  212  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 
1174 aa  211  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  25.69 
 
 
1191 aa  211  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.38 
 
 
1476 aa  210  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  50 
 
 
1199 aa  210  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  26.7 
 
 
1225 aa  210  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  52.66 
 
 
1184 aa  209  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  48.94 
 
 
1186 aa  209  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>