More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1462 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  54.18 
 
 
1214 aa  961    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  67.28 
 
 
1203 aa  1269    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  55.59 
 
 
1194 aa  1070    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  56.58 
 
 
1181 aa  961    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  45.07 
 
 
1172 aa  778    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  58.09 
 
 
1183 aa  1005    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  67.51 
 
 
1191 aa  1296    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  52.76 
 
 
1194 aa  945    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  56.21 
 
 
1227 aa  991    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.24 
 
 
1198 aa  1051    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  61.54 
 
 
1191 aa  1117    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  53.5 
 
 
1217 aa  971    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  54.33 
 
 
1218 aa  971    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.29 
 
 
1188 aa  924    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  52.27 
 
 
1194 aa  952    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  54.31 
 
 
1222 aa  978    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  58.56 
 
 
1224 aa  1176    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  40.89 
 
 
1225 aa  749    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  56.08 
 
 
1191 aa  1100    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  52.08 
 
 
1205 aa  960    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  52.11 
 
 
1195 aa  958    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  60.72 
 
 
1195 aa  1150    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  54.36 
 
 
1199 aa  1044    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  54.61 
 
 
1194 aa  1050    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  52.78 
 
 
1217 aa  978    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  57.38 
 
 
1198 aa  1075    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1186 aa  2238    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  59.67 
 
 
1222 aa  1187    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  61.08 
 
 
1188 aa  1068    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  66.2 
 
 
1213 aa  1278    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  52.11 
 
 
1195 aa  959    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  61.27 
 
 
1188 aa  1226    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  52.11 
 
 
1195 aa  958    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 
1187 aa  520  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.5 
 
 
1187 aa  499  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 
1179 aa  478  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 
1185 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.4 
 
 
1189 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.22 
 
 
1189 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.95 
 
 
1189 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.22 
 
 
1189 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 
1189 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.82 
 
 
1176 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.58 
 
 
1189 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 
1189 aa  465  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.72 
 
 
1190 aa  466  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.64 
 
 
1189 aa  466  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.64 
 
 
1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.64 
 
 
1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 
1185 aa  459  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1190 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 
1176 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 
1176 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.91 
 
 
1175 aa  439  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.67 
 
 
1187 aa  438  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  49.79 
 
 
1263 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.5 
 
 
1177 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  59.01 
 
 
1234 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.74 
 
 
1177 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.93 
 
 
1178 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 
1168 aa  373  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.7 
 
 
1167 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.95 
 
 
1167 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.02 
 
 
1168 aa  366  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.06 
 
 
1167 aa  352  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 
1167 aa  351  5e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 
1170 aa  347  8e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.74 
 
 
1170 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 
1198 aa  324  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.34 
 
 
1175 aa  322  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.2 
 
 
1164 aa  312  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1189 aa  293  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.91 
 
 
1153 aa  292  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  32.91 
 
 
1189 aa  290  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.54 
 
 
1189 aa  289  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 
1196 aa  288  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.81 
 
 
1198 aa  287  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 
1189 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  33.74 
 
 
1174 aa  282  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.6 
 
 
1301 aa  282  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.28 
 
 
1174 aa  281  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.83 
 
 
1191 aa  280  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.07 
 
 
1184 aa  278  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  55.04 
 
 
1186 aa  277  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  32.91 
 
 
1179 aa  277  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  36.98 
 
 
1174 aa  276  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 
1188 aa  267  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 
1188 aa  267  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 
1193 aa  262  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.48 
 
 
1146 aa  258  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.22 
 
 
1191 aa  258  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.33 
 
 
1190 aa  258  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.05 
 
 
1189 aa  258  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 
1179 aa  257  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  54.15 
 
 
1185 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.84 
 
 
1189 aa  255  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  53.66 
 
 
1185 aa  254  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 
1177 aa  254  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  49.08 
 
 
1185 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.41 
 
 
1186 aa  253  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>