More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3916 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1301 aa  2630    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 		 1185 aa  466  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.56 
 
 		 1186 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.72 
 
 		 1175 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 		 1164 aa  337  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.76 
 
 		 1176 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 		 1176 aa  329  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 		 1176 aa  327  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1177 aa  324  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.34 
 
 		 1189 aa  317  9e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.01 
 
 		 1189 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.94 
 
 		 1187 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.15 
 
 		 1189 aa  313  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 		 1185 aa  313  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1190 aa  313  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.99 
 
 		 1190 aa  311  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 		 1189 aa  311  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.23 
 
 		 1196 aa  310  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 		 1176 aa  310  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 		 1181 aa  307  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.17 
 
 		 1175 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.35 
 
 		 1189 aa  303  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.16 
 
 		 1189 aa  301  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.16 
 
 		 1189 aa  301  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.89 
 
 		 1176 aa  301  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.32 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  33.28 
 
 		 1191 aa  300  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.32 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.05 
 
 		 1189 aa  298  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.11 
 
 		 1189 aa  297  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.72 
 
 		 1199 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 		 1198 aa  293  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1199 aa  292  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1199 aa  292  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1204 aa  292  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.61 
 
 		 1187 aa  291  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.82 
 
 		 1187 aa  290  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1190 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1185 aa  288  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  32.72 
 
 		 1179 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.38 
 
 		 1177 aa  285  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.85 
 
 		 1173 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 		 1185 aa  280  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  33.23 
 
 		 1174 aa  278  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.97 
 
 		 1185 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.54 
 
 		 1177 aa  275  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 		 1186 aa  273  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 		 1185 aa  273  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 		 1175 aa  270  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 		 1186 aa  271  8.999999999999999e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 		 1188 aa  268  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 		 1188 aa  268  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.79 
 
 		 1187 aa  268  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.21 
 
 		 1178 aa  267  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  34.06 
 
 		 1194 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 		 1198 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.67 
 
 		 1185 aa  266  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  31.38 
 
 		 1189 aa  261  9e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  33.62 
 
 		 1164 aa  260  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  38.57 
 
 		 1198 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.98 
 
 		 1179 aa  257  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  41.18 
 
 		 1194 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  40.21 
 
 		 1195 aa  255  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.68 
 
 		 1169 aa  255  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  46.01 
 
 		 1188 aa  254  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  43.65 
 
 		 1194 aa  254  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  38.48 
 
 		 1198 aa  252  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 		 1191 aa  252  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 		 1177 aa  252  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 		 1169 aa  252  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  43.64 
 
 		 1195 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  48.43 
 
 		 1133 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  45.16 
 
 		 1179 aa  248  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  43.64 
 
 		 1195 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  43.64 
 
 		 1195 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  41.28 
 
 		 1162 aa  248  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  49.78 
 
 		 1190 aa  248  6e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  44.37 
 
 		 1205 aa  247  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  45.37 
 
 		 1227 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  41.11 
 
 		 1162 aa  246  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.39 
 
 		 1184 aa  246  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  38.8 
 
 		 1138 aa  245  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  43.81 
 
 		 1162 aa  244  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  43.81 
 
 		 1162 aa  244  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  43.45 
 
 		 1184 aa  244  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  40.22 
 
 		 1162 aa  244  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  45.35 
 
 		 1255 aa  244  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  39.94 
 
 		 1162 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1164 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  51.12 
 
 		 1194 aa  244  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  39.61 
 
 		 1162 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  49.38 
 
 		 1186 aa  243  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  40.06 
 
 		 1145 aa  243  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  38.52 
 
 		 1138 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1186 aa  243  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  49.59 
 
 		 1181 aa  243  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  53.17 
 
 		 1214 aa  243  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  49.08 
 
 		 980 aa  243  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  44.9 
 
 		 1164 aa  242  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  39.94 
 
 		 1162 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>