More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5952 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  59.9 
 
 		 1195 aa  1170    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  58.03 
 
 		 1214 aa  1138    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  51.05 
 
 		 1263 aa  967    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  55.88 
 
 		 1181 aa  1008    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  59.26 
 
 		 1217 aa  1166    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  49.31 
 
 		 1217 aa  896    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  55.72 
 
 		 1186 aa  983    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  58.4 
 
 		 1183 aa  1067    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  55.19 
 
 		 1191 aa  974    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  59.51 
 
 		 1194 aa  1170    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  62.28 
 
 		 1198 aa  1257    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.48 
 
 		 1172 aa  692    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.71 
 
 		 1213 aa  931    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  60.87 
 
 		 1194 aa  1220    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  55.07 
 
 		 1191 aa  1018    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  53.96 
 
 		 1227 aa  1043    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  61.87 
 
 		 1188 aa  1068    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.1 
 
 		 1222 aa  996    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  62.03 
 
 		 1198 aa  1246    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  53.48 
 
 		 1195 aa  1015    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  53.05 
 
 		 1203 aa  956    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  61.33 
 
 		 1191 aa  1288    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  59.53 
 
 		 1194 aa  1169    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  59.9 
 
 		 1195 aa  1170    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  56.93 
 
 		 1205 aa  1100    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  74.83 
 
 		 1199 aa  1593    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  40.38 
 
 		 1225 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1194 aa  2307    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  59.48 
 
 		 1195 aa  1158    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  52.2 
 
 		 1222 aa  1023    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  57.18 
 
 		 1224 aa  1193    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  56.06 
 
 		 1188 aa  994    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  55.41 
 
 		 1188 aa  1102    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.9 
 
 		 1187 aa  489  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.1 
 
 		 1190 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  66.75 
 
 		 1218 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  67.94 
 
 		 1234 aa  482  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.28 
 
 		 1176 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.29 
 
 		 1189 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.93 
 
 		 1187 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.1 
 
 		 1175 aa  439  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 		 1176 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1185 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 		 1177 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1188 aa  430  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.49 
 
 		 1173 aa  429  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1188 aa  430  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 		 1186 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.14 
 
 		 1177 aa  379  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.14 
 
 		 1178 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1170 aa  343  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.2 
 
 		 1180 aa  335  4e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1204 aa  333  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1174 aa  332  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1171 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 		 1186 aa  328  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 		 1181 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1164 aa  318  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 		 1190 aa  317  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 		 1190 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 		 1198 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.64 
 
 		 1187 aa  302  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  50.63 
 
 		 1184 aa  296  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.96 
 
 		 1185 aa  280  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  32.59 
 
 		 1174 aa  278  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  57.26 
 
 		 1179 aa  277  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 		 1403 aa  274  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  54.26 
 
 		 1185 aa  272  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 		 1196 aa  271  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.44 
 
 		 1184 aa  269  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.29 
 
 		 1174 aa  268  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.69 
 
 		 1189 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.73 
 
 		 1189 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  49.57 
 
 		 1185 aa  254  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  32.65 
 
 		 1301 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  49.02 
 
 		 1190 aa  253  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1177 aa  253  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  43.67 
 
 		 1176 aa  253  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  35.62 
 
 		 1081 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  49.34 
 
 		 1191 aa  246  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 		 1179 aa  245  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 		 1177 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.25 
 
 		 1189 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.97 
 
 		 1217 aa  242  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  54.41 
 
 		 1187 aa  239  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  31.56 
 
 		 1163 aa  237  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 		 1175 aa  237  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  49.76 
 
 		 1185 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1178 aa  231  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  45.69 
 
 		 1198 aa  224  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  45.87 
 
 		 1186 aa  224  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.61 
 
 		 1189 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.47 
 
 		 1189 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.61 
 
 		 1189 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  39.47 
 
 		 1162 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  39.47 
 
 		 1162 aa  222  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1189 aa  222  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 		 1148 aa  222  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  46.58 
 
 		 1162 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  46.93 
 
 		 1186 aa  221  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>