More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1587 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  50.61 
 
 
1217 aa  910    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  66.58 
 
 
1194 aa  1353    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1194 aa  2308    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  52.92 
 
 
1191 aa  974    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  56.86 
 
 
1214 aa  1089    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  49.03 
 
 
1218 aa  877    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  53.65 
 
 
1183 aa  939    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  60.87 
 
 
1194 aa  1256    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  62.78 
 
 
1205 aa  1290    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  51.65 
 
 
1213 aa  934    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  52.76 
 
 
1203 aa  957    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  60.37 
 
 
1199 aa  1221    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  55.84 
 
 
1191 aa  1117    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  50.52 
 
 
1222 aa  952    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  52.84 
 
 
1195 aa  1001    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  66.11 
 
 
1194 aa  1363    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  65.35 
 
 
1195 aa  1318    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  52.65 
 
 
1224 aa  1064    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.11 
 
 
1198 aa  1095    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  65.58 
 
 
1195 aa  1323    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  55.53 
 
 
1198 aa  1077    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  52.31 
 
 
1191 aa  938    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  55.71 
 
 
1188 aa  922    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  51.96 
 
 
1181 aa  868    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  67.42 
 
 
1217 aa  1388    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  54.54 
 
 
1186 aa  967    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  51.72 
 
 
1222 aa  998    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  39.24 
 
 
1172 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  53 
 
 
1188 aa  932    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  51.99 
 
 
1188 aa  1031    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  38.73 
 
 
1225 aa  698    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  65.58 
 
 
1195 aa  1323    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  52.49 
 
 
1227 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.06 
 
 
1190 aa  506  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 
1179 aa  489  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 
1187 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 
1190 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  54.46 
 
 
1263 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.73 
 
 
1189 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.46 
 
 
1189 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.46 
 
 
1189 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.73 
 
 
1189 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.57 
 
 
1189 aa  465  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.57 
 
 
1189 aa  466  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.49 
 
 
1189 aa  466  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.27 
 
 
1175 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 
1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.3 
 
 
1189 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.8 
 
 
1187 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.37 
 
 
1189 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.08 
 
 
1198 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.87 
 
 
1189 aa  459  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  70.03 
 
 
1234 aa  453  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.29 
 
 
1177 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 
1185 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1188 aa  446  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1188 aa  446  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 
1191 aa  442  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.68 
 
 
1176 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.18 
 
 
1185 aa  437  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.03 
 
 
1179 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.08 
 
 
1173 aa  416  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 
1204 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.76 
 
 
1199 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.2 
 
 
1199 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.2 
 
 
1199 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 
1185 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.74 
 
 
1168 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 
1167 aa  357  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 
1176 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1171 aa  352  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 
1175 aa  351  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.57 
 
 
1171 aa  343  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 
1174 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 
1170 aa  334  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 
1164 aa  333  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.97 
 
 
1186 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.76 
 
 
1164 aa  318  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.73 
 
 
1181 aa  308  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 
1185 aa  306  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 
1196 aa  298  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1186 aa  297  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  37.08 
 
 
1174 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.12 
 
 
1174 aa  285  4.0000000000000003e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  53.28 
 
 
1184 aa  285  5.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.15 
 
 
1185 aa  284  8.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 
1308 aa  278  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.75 
 
 
1187 aa  273  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.58 
 
 
1134 aa  271  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 
1301 aa  268  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.72 
 
 
1189 aa  259  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.02 
 
 
1185 aa  259  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  51.57 
 
 
1185 aa  257  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.74 
 
 
1177 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  48.25 
 
 
1190 aa  254  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  55.88 
 
 
1187 aa  249  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 
1179 aa  248  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 
1178 aa  245  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.28 
 
 
1190 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 
1175 aa  244  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>