More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0181 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  95.71 
 
 		 1189 aa  2229    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  95.46 
 
 		 1189 aa  2249    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  79.06 
 
 		 1189 aa  1869    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  60.18 
 
 		 1191 aa  1333    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1189 aa  2351    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.84 
 
 		 1174 aa  501  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.09 
 
 		 1175 aa  478  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1188 aa  462  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 		 1184 aa  451  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  30.08 
 
 		 1193 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 		 1171 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1189 aa  429  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  30.01 
 
 		 1192 aa  428  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  31.8 
 
 		 1172 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.43 
 
 		 1146 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1196 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  29.54 
 
 		 1149 aa  393  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  28.51 
 
 		 1146 aa  386  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 		 1146 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1226 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 		 1147 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  27.3 
 
 		 1226 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.52 
 
 		 1194 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  28.9 
 
 		 1196 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.11 
 
 		 1196 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.9 
 
 		 1196 aa  366  2e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  27.27 
 
 		 1219 aa  365  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 		 1198 aa  357  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.5 
 
 		 1190 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1217 aa  356  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.04 
 
 		 1187 aa  353  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.96 
 
 		 1187 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 		 1198 aa  350  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.19 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1185 aa  344  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.55 
 
 		 1188 aa  343  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.22 
 
 		 1189 aa  343  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.55 
 
 		 1188 aa  343  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.64 
 
 		 1189 aa  340  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.08 
 
 		 1189 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26 
 
 		 1189 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26 
 
 		 1189 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 		 1190 aa  337  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.87 
 
 		 1189 aa  337  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 		 1189 aa  337  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.77 
 
 		 1189 aa  333  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.3 
 
 		 1189 aa  333  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  25.88 
 
 		 1189 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  25.88 
 
 		 1189 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  25.82 
 
 		 1204 aa  330  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.97 
 
 		 1185 aa  327  8.000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 		 1196 aa  325  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.66 
 
 		 1201 aa  323  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1170 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.13 
 
 		 1207 aa  322  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  27.52 
 
 		 1183 aa  321  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.38 
 
 		 1187 aa  318  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.16 
 
 		 1174 aa  318  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 		 1164 aa  317  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1191 aa  310  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.36 
 
 		 1179 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1186 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  24.9 
 
 		 1202 aa  309  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.52 
 
 		 1199 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.37 
 
 		 1177 aa  303  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.37 
 
 		 1199 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.37 
 
 		 1199 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  24.75 
 
 		 1174 aa  298  3e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 		 1177 aa  295  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 		 1153 aa  291  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.81 
 
 		 1184 aa  286  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.15 
 
 		 1186 aa  285  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 		 1190 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 		 1181 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 		 1176 aa  269  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  23.6 
 
 		 1176 aa  267  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.9 
 
 		 1180 aa  266  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.48 
 
 		 1176 aa  265  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.86 
 
 		 1174 aa  264  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.86 
 
 		 1191 aa  261  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  23.49 
 
 		 1175 aa  255  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1179 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.4 
 
 		 1134 aa  254  8.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23.23 
 
 		 1179 aa  251  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.43 
 
 		 1178 aa  251  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1176 aa  251  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1186 aa  250  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  22.53 
 
 		 1204 aa  248  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  25.1 
 
 		 1171 aa  241  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  22.8 
 
 		 1168 aa  240  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.92 
 
 		 1177 aa  239  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  23.88 
 
 		 1194 aa  237  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  22.52 
 
 		 1167 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 		 1148 aa  237  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  22.52 
 
 		 1167 aa  236  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1148 aa  234  8.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  23.64 
 
 		 1162 aa  234  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  23.27 
 
 		 1162 aa  231  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.69 
 
 		 1209 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>