More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2185 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  58.59 
 
 
1147 aa  1303    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  35.02 
 
 
1193 aa  640    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  34.8 
 
 
1175 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1146 aa  2303    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 
1146 aa  1028    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  46.89 
 
 
1149 aa  1023    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  35.74 
 
 
1174 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  57.55 
 
 
1146 aa  1304    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  35.28 
 
 
1192 aa  626  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  35.16 
 
 
1188 aa  608  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  34.73 
 
 
1189 aa  608  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  33.93 
 
 
1171 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  34.02 
 
 
1196 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 
1198 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  32.64 
 
 
1226 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 
1226 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 
1217 aa  512  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  30.66 
 
 
1219 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.25 
 
 
1201 aa  463  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  31.31 
 
 
1183 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.18 
 
 
1196 aa  446  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.61 
 
 
1196 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.41 
 
 
1207 aa  406  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 
1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28.82 
 
 
1189 aa  395  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1189 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 
1189 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  34.7 
 
 
1190 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  33.42 
 
 
1208 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.28 
 
 
1187 aa  357  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  33.29 
 
 
1204 aa  334  5e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.46 
 
 
1194 aa  311  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 
1188 aa  310  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 
1188 aa  310  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.17 
 
 
1189 aa  310  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 
1189 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.04 
 
 
1187 aa  305  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  34.18 
 
 
1202 aa  303  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 
1184 aa  300  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  27.23 
 
 
1176 aa  300  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.86 
 
 
1189 aa  299  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.99 
 
 
1189 aa  298  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  31.17 
 
 
1196 aa  297  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.22 
 
 
1186 aa  296  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.08 
 
 
1189 aa  293  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.25 
 
 
1185 aa  291  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 
1196 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.77 
 
 
1191 aa  280  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.98 
 
 
1174 aa  278  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 
1175 aa  277  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 
1176 aa  277  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 
1185 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.97 
 
 
1175 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.92 
 
 
1174 aa  275  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.41 
 
 
1191 aa  273  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 
1177 aa  273  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 
1177 aa  268  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.04 
 
 
1177 aa  268  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.5 
 
 
1187 aa  266  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 
1172 aa  265  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  26.52 
 
 
1176 aa  259  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 
1181 aa  257  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 
1148 aa  256  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  26.33 
 
 
1209 aa  253  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  24.45 
 
 
1173 aa  250  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.72 
 
 
1172 aa  249  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 
1204 aa  248  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.2 
 
 
1184 aa  248  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.34 
 
 
1164 aa  247  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.45 
 
 
1185 aa  247  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.32 
 
 
1180 aa  245  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.9 
 
 
1215 aa  242  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.79 
 
 
1174 aa  239  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 
1170 aa  233  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 
1148 aa  233  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 
1191 aa  231  5e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1170 aa  229  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.06 
 
 
1178 aa  228  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  23.83 
 
 
1171 aa  225  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  22.81 
 
 
1169 aa  224  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  23.35 
 
 
1169 aa  223  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.8 
 
 
1186 aa  217  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 
1190 aa  217  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  23.75 
 
 
1476 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  24.69 
 
 
1208 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 
1403 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  23.13 
 
 
1178 aa  212  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  52.11 
 
 
1195 aa  210  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.04 
 
 
1134 aa  206  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.65 
 
 
1189 aa  204  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.65 
 
 
1189 aa  204  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.47 
 
 
1189 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.47 
 
 
1189 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.87 
 
 
1189 aa  201  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  26.54 
 
 
1189 aa  201  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  25.26 
 
 
1167 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.43 
 
 
1179 aa  197  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  23.85 
 
 
1164 aa  195  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  23.2 
 
 
1164 aa  194  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 
1198 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>