More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2045 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  41.24 
 
 		 1201 aa  867    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  50.5 
 
 		 1190 aa  1100    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  42.62 
 
 		 1207 aa  878    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  44.69 
 
 		 1184 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  40.75 
 
 		 1183 aa  830    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.38 
 
 		 1194 aa  791    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  54.57 
 
 		 1208 aa  1176    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  44.35 
 
 		 1204 aa  826    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  45.88 
 
 		 1202 aa  825    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  37.07 
 
 		 1196 aa  788    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1195 aa  2335    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  50.12 
 
 		 1226 aa  1096    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.47 
 
 		 1196 aa  800    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.79 
 
 		 1196 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  50.04 
 
 		 1226 aa  1093    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  55.31 
 
 		 1198 aa  1125    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  51.59 
 
 		 1219 aa  1156    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  52.95 
 
 		 1217 aa  1157    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.25 
 
 		 1175 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.34 
 
 		 1174 aa  555  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 		 1171 aa  537  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  31.56 
 
 		 1189 aa  530  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 		 1192 aa  532  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1188 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 		 1193 aa  526  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  34 
 
 		 1147 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  30.82 
 
 		 1146 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 		 1146 aa  511  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.39 
 
 		 1149 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1146 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 		 1184 aa  436  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.34 
 
 		 1189 aa  399  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 		 1191 aa  391  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.8 
 
 		 1189 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1189 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.49 
 
 		 1172 aa  393  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  23.81 
 
 		 1189 aa  372  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 		 1187 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 		 1185 aa  324  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.45 
 
 		 1190 aa  319  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.14 
 
 		 1196 aa  311  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1186 aa  308  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.66 
 
 		 1185 aa  307  7e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.44 
 
 		 1189 aa  300  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.81 
 
 		 1189 aa  299  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.52 
 
 		 1174 aa  294  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.73 
 
 		 1189 aa  292  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 		 1189 aa  293  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 		 1190 aa  293  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.73 
 
 		 1189 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  25.46 
 
 		 1189 aa  292  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  25.46 
 
 		 1189 aa  292  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.5 
 
 		 1189 aa  291  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1188 aa  291  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1188 aa  291  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.64 
 
 		 1187 aa  290  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  25.5 
 
 		 1189 aa  290  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.42 
 
 		 1189 aa  288  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.27 
 
 		 1177 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.61 
 
 		 1191 aa  281  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 		 1189 aa  281  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1148 aa  274  7e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  26.73 
 
 		 1179 aa  273  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.7 
 
 		 1186 aa  273  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.18 
 
 		 1177 aa  269  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  24.4 
 
 		 1189 aa  265  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 		 1176 aa  258  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.14 
 
 		 1153 aa  253  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  23.94 
 
 		 1476 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  22.78 
 
 		 1170 aa  252  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  23.91 
 
 		 1148 aa  248  6.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  25.52 
 
 		 1179 aa  247  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1185 aa  245  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  25.49 
 
 		 1176 aa  243  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  21.96 
 
 		 1174 aa  241  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  22.73 
 
 		 1204 aa  241  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.66 
 
 		 1186 aa  238  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  21.52 
 
 		 1180 aa  237  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  27.07 
 
 		 1194 aa  235  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.34 
 
 		 1178 aa  234  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.05 
 
 		 1174 aa  229  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 		 1185 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  25.69 
 
 		 1177 aa  227  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.2 
 
 		 1164 aa  227  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.83 
 
 		 1134 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.61 
 
 		 1185 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  42.48 
 
 		 1196 aa  219  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  23.26 
 
 		 1240 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  24.83 
 
 		 1176 aa  218  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  26.81 
 
 		 1175 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1181 aa  216  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  24.14 
 
 		 1175 aa  213  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1174 aa  212  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.09 
 
 		 1185 aa  211  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 		 1182 aa  209  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1177 aa  209  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 		 1198 aa  208  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  23.48 
 
 		 1195 aa  207  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 		 1171 aa  205  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 		 1190 aa  204  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>