More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00651 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  100 
 
 
1207 aa  2426    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  39.59 
 
 
1217 aa  781    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  40.39 
 
 
1226 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  47.52 
 
 
1196 aa  1025    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  61.45 
 
 
1201 aa  1450    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  61.12 
 
 
1183 aa  1411    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  41.12 
 
 
1208 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  48.31 
 
 
1194 aa  1036    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  62.46 
 
 
1204 aa  1437    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  62.78 
 
 
1202 aa  1403    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  47.95 
 
 
1196 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  65.2 
 
 
1184 aa  1431    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  47.77 
 
 
1196 aa  1033    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  40.16 
 
 
1226 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  39.84 
 
 
1219 aa  787    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  40.78 
 
 
1190 aa  769    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  40.26 
 
 
1198 aa  749    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.62 
 
 
1174 aa  505  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  33.44 
 
 
1171 aa  501  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 
1189 aa  476  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 
1192 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 
1193 aa  463  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 
1147 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 
1146 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.56 
 
 
1184 aa  387  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  59.79 
 
 
1195 aa  348  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 
1172 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 
1191 aa  343  9e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 
1189 aa  340  7e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 
1189 aa  325  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  26.13 
 
 
1189 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  32.49 
 
 
1149 aa  313  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 
1185 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  32.72 
 
 
1146 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.14 
 
 
1185 aa  278  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.46 
 
 
1187 aa  277  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 
1146 aa  271  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  24.96 
 
 
1190 aa  271  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 
1196 aa  267  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 
1188 aa  267  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 
1188 aa  267  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.81 
 
 
1185 aa  252  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 
1148 aa  251  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.37 
 
 
1189 aa  244  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 
1186 aa  243  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  23.41 
 
 
1190 aa  240  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.33 
 
 
1191 aa  239  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 
1189 aa  239  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 
1164 aa  236  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.51 
 
 
1187 aa  225  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.81 
 
 
1184 aa  223  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.58 
 
 
1180 aa  221  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  41.79 
 
 
1175 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.67 
 
 
1177 aa  220  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 
1148 aa  218  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 
1170 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  24.01 
 
 
1172 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 
1179 aa  214  9e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 
1170 aa  214  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.95 
 
 
1177 aa  212  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  36.95 
 
 
1188 aa  212  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.55 
 
 
1199 aa  212  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  38.13 
 
 
1196 aa  205  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.68 
 
 
1171 aa  204  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 
1199 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 
1199 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 
1181 aa  201  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 
1187 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.62 
 
 
1186 aa  194  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  24.64 
 
 
1173 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  24.34 
 
 
1167 aa  190  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.46 
 
 
1198 aa  190  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.98 
 
 
1179 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  24.34 
 
 
1167 aa  189  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  23.8 
 
 
1176 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.49 
 
 
1215 aa  186  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  25.53 
 
 
1201 aa  184  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.57 
 
 
1174 aa  183  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  23.95 
 
 
1195 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  24.71 
 
 
1185 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25 
 
 
1189 aa  175  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.71 
 
 
1185 aa  175  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 
1167 aa  174  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.53 
 
 
1179 aa  169  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  27.57 
 
 
1187 aa  168  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  22.2 
 
 
1164 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 
1167 aa  160  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  37 
 
 
1189 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.37 
 
 
1191 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.87 
 
 
1134 aa  155  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  24.85 
 
 
1174 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.6 
 
 
1403 aa  148  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.42 
 
 
1176 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.46 
 
 
1189 aa  144  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1194 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 
1189 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  40.83 
 
 
1194 aa  139  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  39.11 
 
 
1194 aa  138  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  27.99 
 
 
952 aa  137  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  41.79 
 
 
1188 aa  136  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>