More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1592 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  100 
 
 		 1178 aa  2375    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  42.25 
 
 		 1176 aa  944    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  33.55 
 
 		 1186 aa  631  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  34.3 
 
 		 1179 aa  632  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  33.66 
 
 		 1185 aa  622  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1178 aa  618  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1177 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 		 1190 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 		 1176 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.85 
 
 		 1176 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1176 aa  503  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.26 
 
 		 1175 aa  498  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 		 1187 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1177 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 		 1199 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 		 1199 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  28.51 
 
 		 1199 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  28.74 
 
 		 1198 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.7 
 
 		 1176 aa  479  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.72 
 
 		 1198 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.85 
 
 		 1173 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1191 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.01 
 
 		 1189 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.5 
 
 		 1190 aa  459  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1185 aa  459  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.94 
 
 		 1189 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.11 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 		 1176 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1196 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1204 aa  422  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 		 1188 aa  419  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.35 
 
 		 1179 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 		 1188 aa  419  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.49 
 
 		 1187 aa  416  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.72 
 
 		 1177 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.95 
 
 		 1174 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  27.85 
 
 		 1179 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1167 aa  396  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.21 
 
 		 1177 aa  395  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.96 
 
 		 1184 aa  385  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.81 
 
 		 1185 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  26.47 
 
 		 1168 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  26.95 
 
 		 1171 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  27.45 
 
 		 1186 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.06 
 
 		 1167 aa  376  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 		 1167 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  27.37 
 
 		 1162 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.34 
 
 		 1169 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.32 
 
 		 1169 aa  373  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1164 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 		 1171 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  26.81 
 
 		 1171 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1164 aa  363  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1174 aa  361  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 		 1164 aa  361  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 		 1308 aa  360  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1173 aa  357  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1403 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  29.12 
 
 		 1180 aa  352  3e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  26.11 
 
 		 1175 aa  347  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 		 1170 aa  346  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1170 aa  343  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 		 1190 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 		 1181 aa  337  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 		 1181 aa  331  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 		 1164 aa  330  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.42 
 
 		 1174 aa  286  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.1 
 
 		 1174 aa  284  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 		 1153 aa  281  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  22.94 
 
 		 1171 aa  281  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.36 
 
 		 1190 aa  279  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.24 
 
 		 1185 aa  276  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.69 
 
 		 1134 aa  274  6e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1187 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.48 
 
 		 1172 aa  261  7e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 		 1301 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  25.88 
 
 		 1191 aa  254  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.16 
 
 		 1149 aa  253  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 		 1189 aa  251  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 		 1191 aa  251  6e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1194 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 		 1186 aa  247  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 		 1255 aa  244  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  43.69 
 
 		 980 aa  243  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 		 1184 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  26.44 
 
 		 1185 aa  241  6.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  23.06 
 
 		 1146 aa  239  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.93 
 
 		 1190 aa  238  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  38.59 
 
 		 1148 aa  238  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  48.31 
 
 		 1185 aa  237  8e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  46.31 
 
 		 1189 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  46.31 
 
 		 1189 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  48.31 
 
 		 1185 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  45.9 
 
 		 1189 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  45.9 
 
 		 1189 aa  235  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  45.9 
 
 		 1189 aa  234  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  45.9 
 
 		 1189 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  45.9 
 
 		 1189 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  32.3 
 
 		 1198 aa  234  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>