More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0927 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  39.03 
 
 
1185 aa  737    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  37.91 
 
 
1189 aa  738    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  38.01 
 
 
1189 aa  738    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  37.84 
 
 
1189 aa  735    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  37.71 
 
 
1189 aa  736    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  37.95 
 
 
1189 aa  742    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  39.47 
 
 
1196 aa  759    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  39.78 
 
 
1187 aa  811    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  100 
 
 
1190 aa  2370    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  38.01 
 
 
1189 aa  738    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  38.63 
 
 
1189 aa  763    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 
1191 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  37.84 
 
 
1189 aa  735    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  35.95 
 
 
1185 aa  691    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  38.93 
 
 
1187 aa  778    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  38.01 
 
 
1198 aa  746    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 
1189 aa  741    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  35.7 
 
 
1188 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  38.62 
 
 
1189 aa  758    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  35.7 
 
 
1188 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  37.37 
 
 
1185 aa  714    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 
1185 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  36.93 
 
 
1186 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  64.28 
 
 
1190 aa  1507    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  38.33 
 
 
1189 aa  749    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  33.78 
 
 
1189 aa  625  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  34.66 
 
 
1174 aa  624  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  34.22 
 
 
1186 aa  617  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  33.58 
 
 
1185 aa  618  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.77 
 
 
1176 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  33.71 
 
 
1176 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  34.61 
 
 
1177 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  33.06 
 
 
1177 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.56 
 
 
1187 aa  591  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  33.12 
 
 
1177 aa  592  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.91 
 
 
1175 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1176 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.45 
 
 
1173 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  32.59 
 
 
1191 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  35.14 
 
 
1184 aa  577  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.71 
 
 
1176 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.6 
 
 
1199 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 
1199 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.57 
 
 
1198 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 
1199 aa  559  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 
1204 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  32.16 
 
 
1172 aa  529  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 
1201 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1194 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  30.05 
 
 
1185 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 
1174 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  30.12 
 
 
1195 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.55 
 
 
1179 aa  473  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  29.88 
 
 
1195 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  29.88 
 
 
1195 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  31.42 
 
 
1175 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 
1194 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1164 aa  460  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 
1178 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 
1181 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1170 aa  459  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 
1148 aa  459  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.5 
 
 
1178 aa  459  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 
1170 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.18 
 
 
1186 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.36 
 
 
1177 aa  451  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  31.77 
 
 
1180 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  36.59 
 
 
1179 aa  432  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29 
 
 
1403 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 
1167 aa  413  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  28.73 
 
 
1168 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 
1164 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  28.86 
 
 
1163 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 
1184 aa  402  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  28.36 
 
 
1168 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  28.5 
 
 
1175 aa  399  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 
1167 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  26.71 
 
 
1167 aa  396  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  27.62 
 
 
1172 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 
1190 aa  396  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 
1175 aa  396  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  27.71 
 
 
1162 aa  393  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 
1167 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.84 
 
 
1198 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 
1198 aa  386  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 
1170 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.01 
 
 
1168 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 
1202 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  27.22 
 
 
1268 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 
1170 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 
1200 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 
1170 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 
1170 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  27.22 
 
 
1164 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.61 
 
 
1174 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  28.24 
 
 
1170 aa  365  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.15 
 
 
1308 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 
1191 aa  365  4e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.52 
 
 
1174 aa  364  4e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  27.42 
 
 
1175 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>