More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1350 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  100 
 
 
1174 aa  2299    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  33.11 
 
 
1170 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  32.99 
 
 
1170 aa  571  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  31.71 
 
 
1164 aa  541  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 
1153 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1185 aa  432  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.43 
 
 
1187 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.1 
 
 
1175 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.04 
 
 
1199 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  29.89 
 
 
1180 aa  379  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.06 
 
 
1199 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1196 aa  380  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 
1187 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  25.02 
 
 
1176 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.08 
 
 
1199 aa  376  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 
1198 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 
1188 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 
1188 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.61 
 
 
1190 aa  370  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 
1198 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  26.35 
 
 
1185 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.76 
 
 
1190 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1185 aa  366  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 
1176 aa  362  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 
1176 aa  361  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  25.94 
 
 
1177 aa  358  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1177 aa  358  5e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.46 
 
 
1189 aa  357  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.97 
 
 
1187 aa  355  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.55 
 
 
1186 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.04 
 
 
1189 aa  352  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.34 
 
 
1189 aa  351  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  26.03 
 
 
1204 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.16 
 
 
1176 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 
1189 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  23.88 
 
 
1173 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 
1191 aa  341  5.9999999999999996e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.52 
 
 
1189 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 
1175 aa  335  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  27.4 
 
 
1184 aa  333  9e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.78 
 
 
1177 aa  331  5.0000000000000004e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.73 
 
 
1186 aa  328  3e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  26.43 
 
 
1172 aa  326  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.44 
 
 
1191 aa  324  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.68 
 
 
1174 aa  311  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  24 
 
 
1173 aa  308  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 
1181 aa  306  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  23.17 
 
 
1164 aa  299  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 
1185 aa  295  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 
1181 aa  295  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  22.7 
 
 
1167 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  21.88 
 
 
1134 aa  291  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  24.25 
 
 
1168 aa  291  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  24.9 
 
 
1179 aa  290  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  23.9 
 
 
1198 aa  289  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  23.74 
 
 
1171 aa  287  7e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  22.97 
 
 
1171 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  22.97 
 
 
1255 aa  286  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.24 
 
 
1178 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  24.5 
 
 
1176 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  23.53 
 
 
1268 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1171 aa  285  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  23.36 
 
 
1190 aa  283  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  22.34 
 
 
1162 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  23.19 
 
 
1168 aa  283  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  25.3 
 
 
1164 aa  282  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  22.69 
 
 
1162 aa  283  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  25.79 
 
 
1164 aa  282  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  23.72 
 
 
1198 aa  281  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22 
 
 
1403 aa  281  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  23.13 
 
 
1171 aa  281  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  21.99 
 
 
1171 aa  279  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 
1177 aa  279  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 
1191 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.83 
 
 
1172 aa  275  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 
1184 aa  275  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  23.38 
 
 
1167 aa  275  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  22.63 
 
 
1167 aa  274  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  23.58 
 
 
1167 aa  274  7e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.99 
 
 
1189 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.36 
 
 
1185 aa  271  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  23.33 
 
 
1152 aa  270  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 
1189 aa  268  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  22.2 
 
 
1205 aa  268  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 
1189 aa  266  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.8 
 
 
1189 aa  267  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  22.92 
 
 
1188 aa  266  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  22.11 
 
 
1150 aa  263  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  23.79 
 
 
1308 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  25.25 
 
 
1189 aa  261  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  22.03 
 
 
1150 aa  261  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  24.21 
 
 
1178 aa  257  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  22.52 
 
 
1192 aa  257  8e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.47 
 
 
1186 aa  257  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  22.75 
 
 
1149 aa  254  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 
1185 aa  251  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 
1148 aa  250  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 
1185 aa  249  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.14 
 
 
1219 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  22.96 
 
 
1208 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>