More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1986 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  51.44 
 
 
1185 aa  1109    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  55.49 
 
 
1177 aa  1222    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  52.27 
 
 
1190 aa  1065    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  50.59 
 
 
1186 aa  1086    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1178 aa  2368    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  59.27 
 
 
1179 aa  1339    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  32.98 
 
 
1178 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.97 
 
 
1175 aa  502  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.63 
 
 
1176 aa  486  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 
1176 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.43 
 
 
1176 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 
1187 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.83 
 
 
1176 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.57 
 
 
1185 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.11 
 
 
1190 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 
1177 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.05 
 
 
1198 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 
1204 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.09 
 
 
1173 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 
1191 aa  438  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 
1190 aa  432  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 
1186 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 
1189 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 
1177 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 
1185 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.9 
 
 
1174 aa  405  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  31.07 
 
 
1179 aa  403  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.94 
 
 
1188 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.85 
 
 
1177 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.94 
 
 
1188 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.79 
 
 
1189 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.25 
 
 
1187 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.84 
 
 
1184 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.14 
 
 
1186 aa  383  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 
1185 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 
1403 aa  355  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.82 
 
 
1180 aa  343  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  28.04 
 
 
1168 aa  342  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.79 
 
 
1191 aa  338  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.36 
 
 
1164 aa  337  9e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.24 
 
 
1171 aa  336  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1170 aa  334  5e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 
1167 aa  333  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  26.87 
 
 
1172 aa  333  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 
1150 aa  327  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 
1170 aa  327  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 
1150 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.99 
 
 
1176 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 
1308 aa  315  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 
1164 aa  296  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 
1190 aa  295  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.43 
 
 
1187 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 
1196 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.84 
 
 
1176 aa  267  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.28 
 
 
1174 aa  261  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.45 
 
 
1174 aa  259  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.87 
 
 
1175 aa  258  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.61 
 
 
1184 aa  256  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.31 
 
 
1171 aa  252  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.9 
 
 
1148 aa  251  8e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  45.99 
 
 
1189 aa  245  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  45.99 
 
 
1189 aa  244  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  44.89 
 
 
1189 aa  240  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.21 
 
 
1189 aa  240  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  47.43 
 
 
1189 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  47.43 
 
 
1189 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  47.43 
 
 
1189 aa  239  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  47.43 
 
 
1189 aa  239  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 
1255 aa  239  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  47.43 
 
 
1189 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  47.04 
 
 
1189 aa  238  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  47.04 
 
 
1189 aa  238  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 
1191 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  43.91 
 
 
980 aa  235  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 
1199 aa  234  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  47.53 
 
 
1185 aa  234  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  29.43 
 
 
1199 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 
1301 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 
1199 aa  232  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  47.09 
 
 
1185 aa  232  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 
1188 aa  224  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 
1175 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  45.22 
 
 
1174 aa  221  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 
1179 aa  218  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 
1194 aa  217  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  45.54 
 
 
1187 aa  216  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 
1192 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  28.05 
 
 
1205 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  28.96 
 
 
1191 aa  214  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  38.83 
 
 
1183 aa  214  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  26.86 
 
 
1195 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  23.92 
 
 
1193 aa  213  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 
1194 aa  211  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  41.26 
 
 
1203 aa  211  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 
1181 aa  210  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  40.33 
 
 
1188 aa  210  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  38.7 
 
 
1194 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  27.98 
 
 
1198 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  33.54 
 
 
1195 aa  209  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  40.16 
 
 
1185 aa  209  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>