More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1167 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1255 aa  2514    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.09 
 
 		 1187 aa  532  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1187 aa  512  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 		 1189 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 		 1189 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 		 1177 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.99 
 
 		 1189 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.03 
 
 		 1189 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 		 1198 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.84 
 
 		 1189 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1148 aa  465  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.41 
 
 		 1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.33 
 
 		 1189 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.91 
 
 		 1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.41 
 
 		 1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.42 
 
 		 1186 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 		 1191 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1188 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1188 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 		 1199 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  31.57 
 
 		 1177 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.79 
 
 		 1199 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1199 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.29 
 
 		 1175 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.02 
 
 		 1187 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 		 1185 aa  445  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.42 
 
 		 1189 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.54 
 
 		 1177 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.19 
 
 		 1186 aa  431  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.95 
 
 		 1179 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.85 
 
 		 1174 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.54 
 
 		 1186 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.48 
 
 		 1185 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 		 1177 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.52 
 
 		 1185 aa  390  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 		 1164 aa  379  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 		 1175 aa  366  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1170 aa  353  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 		 1181 aa  349  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.25 
 
 		 1190 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 		 1308 aa  336  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 		 1196 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 		 1190 aa  307  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 		 1185 aa  290  9e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.68 
 
 		 1174 aa  290  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.13 
 
 		 1187 aa  284  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.32 
 
 		 1176 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  29.78 
 
 		 1176 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 		 1171 aa  280  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.33 
 
 		 1175 aa  279  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 		 1198 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 		 1176 aa  279  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1176 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.16 
 
 		 1185 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.12 
 
 		 1189 aa  269  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.72 
 
 		 1184 aa  268  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  54.75 
 
 		 1185 aa  267  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.28 
 
 		 1173 aa  262  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1179 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.64 
 
 		 1134 aa  261  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.52 
 
 		 1193 aa  260  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 		 1175 aa  259  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 		 1204 aa  257  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.16 
 
 		 1191 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.98 
 
 		 1189 aa  254  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  41.03 
 
 		 980 aa  253  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.73 
 
 		 1178 aa  252  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  51.87 
 
 		 1184 aa  250  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1178 aa  248  8e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.59 
 
 		 1301 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  29.46 
 
 		 1172 aa  241  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.69 
 
 		 1180 aa  241  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.71 
 
 		 1191 aa  240  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1190 aa  234  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  47.17 
 
 		 1198 aa  233  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  25.6 
 
 		 1185 aa  230  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  44.3 
 
 		 1190 aa  229  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.6 
 
 		 1146 aa  227  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  47.17 
 
 		 1198 aa  227  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  44.06 
 
 		 1234 aa  227  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  49.78 
 
 		 1217 aa  226  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  38.48 
 
 		 1162 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  49.15 
 
 		 1186 aa  225  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 		 1224 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  50.21 
 
 		 1218 aa  226  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  45.32 
 
 		 1191 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  44.1 
 
 		 1194 aa  225  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  48.95 
 
 		 1194 aa  224  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  45.45 
 
 		 1188 aa  224  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  49.78 
 
 		 1199 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.06 
 
 		 1174 aa  224  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  44.64 
 
 		 1183 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  44.96 
 
 		 1194 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.06 
 
 		 1213 aa  223  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1162 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  46.72 
 
 		 1227 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1162 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  34.97 
 
 		 1142 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>