More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1367 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  51.42 
 
 
1184 aa  1018    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  49.54 
 
 
1174 aa  933    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  39.88 
 
 
1179 aa  712    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1186 aa  2300    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.61 
 
 
1187 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.44 
 
 
1189 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 
1189 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.4 
 
 
1189 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1189 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.93 
 
 
1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.93 
 
 
1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.66 
 
 
1189 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.76 
 
 
1189 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.65 
 
 
1189 aa  466  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.66 
 
 
1189 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.63 
 
 
1189 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 
1196 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 
1185 aa  452  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.61 
 
 
1185 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.94 
 
 
1186 aa  444  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1191 aa  442  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.34 
 
 
1190 aa  440  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 
1188 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 
1188 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.41 
 
 
1175 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.1 
 
 
1189 aa  432  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 
1176 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.34 
 
 
1176 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.81 
 
 
1179 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.86 
 
 
1199 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.99 
 
 
1199 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 
1176 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 
1199 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.69 
 
 
1177 aa  391  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 
1198 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.13 
 
 
1172 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.96 
 
 
1198 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 
1170 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.29 
 
 
1167 aa  376  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 
1170 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  28.78 
 
 
1195 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1170 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 
1170 aa  373  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1171 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 
1170 aa  373  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.85 
 
 
1191 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  31.08 
 
 
1268 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 
1170 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 
1170 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  30.37 
 
 
1171 aa  364  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 
1172 aa  364  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  30.49 
 
 
1168 aa  364  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.05 
 
 
1171 aa  364  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 
1170 aa  363  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 
1170 aa  363  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.61 
 
 
1169 aa  363  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 
1170 aa  361  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 
1200 aa  361  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 
1202 aa  361  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1169 aa  361  4e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.36 
 
 
1178 aa  357  5.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  31.08 
 
 
1206 aa  356  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 
1182 aa  355  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 
1171 aa  354  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  30.75 
 
 
1142 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.35 
 
 
1167 aa  347  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 
1190 aa  346  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 
1178 aa  346  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.5 
 
 
1168 aa  345  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 
1181 aa  336  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.54 
 
 
1164 aa  317  9e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.6 
 
 
1180 aa  311  5.9999999999999995e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  53 
 
 
1188 aa  298  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  55.43 
 
 
1191 aa  297  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  55.73 
 
 
1183 aa  296  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 
1403 aa  295  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  47.07 
 
 
1198 aa  293  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  55.68 
 
 
1227 aa  292  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  55.35 
 
 
1218 aa  291  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  56.42 
 
 
1194 aa  290  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  50.64 
 
 
1198 aa  289  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  59.24 
 
 
1217 aa  289  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  53.82 
 
 
1181 aa  287  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  53.19 
 
 
1194 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  45.92 
 
 
1224 aa  286  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  55.69 
 
 
1222 aa  286  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  52.54 
 
 
1263 aa  285  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  56 
 
 
1199 aa  284  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  53.82 
 
 
1234 aa  281  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  49.84 
 
 
1194 aa  281  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  47.48 
 
 
1187 aa  279  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.43 
 
 
1186 aa  278  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  51.8 
 
 
1188 aa  278  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  44.25 
 
 
1191 aa  278  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  52.28 
 
 
1214 aa  278  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  46.46 
 
 
1217 aa  278  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  54.58 
 
 
1188 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 
1198 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.64 
 
 
1308 aa  275  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  50.76 
 
 
1222 aa  273  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>