More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05690 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1184 aa  2354    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  50.84 
 
 		 1186 aa  949    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  46.06 
 
 		 1174 aa  855    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  38.22 
 
 		 1179 aa  667    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1187 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.41 
 
 		 1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.09 
 
 		 1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.12 
 
 		 1189 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.24 
 
 		 1196 aa  446  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1189 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 		 1185 aa  446  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.82 
 
 		 1189 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.08 
 
 		 1189 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.82 
 
 		 1189 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.98 
 
 		 1189 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.89 
 
 		 1189 aa  439  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.98 
 
 		 1189 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.41 
 
 		 1189 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.18 
 
 		 1190 aa  439  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.15 
 
 		 1190 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.71 
 
 		 1189 aa  426  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.87 
 
 		 1185 aa  402  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.16 
 
 		 1177 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.18 
 
 		 1186 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.13 
 
 		 1174 aa  395  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 		 1177 aa  373  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.93 
 
 		 1184 aa  373  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1178 aa  366  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1185 aa  364  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.02 
 
 		 1167 aa  359  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 		 1167 aa  357  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.53 
 
 		 1171 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 		 1171 aa  320  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  28.74 
 
 		 1152 aa  313  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  56.57 
 
 		 1194 aa  294  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  49.37 
 
 		 1195 aa  293  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  49.37 
 
 		 1195 aa  293  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  49.37 
 
 		 1195 aa  293  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  48.6 
 
 		 1194 aa  292  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  50.63 
 
 		 1194 aa  291  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  57.92 
 
 		 1198 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  57.98 
 
 		 1198 aa  285  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  53.28 
 
 		 1194 aa  284  8.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  57.69 
 
 		 1199 aa  283  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  51.39 
 
 		 1205 aa  281  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  58.55 
 
 		 1263 aa  281  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.14 
 
 		 1187 aa  281  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  54.55 
 
 		 1227 aa  281  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  57.14 
 
 		 1218 aa  279  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  55.88 
 
 		 1183 aa  279  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  50 
 
 		 1188 aa  274  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  54.07 
 
 		 1181 aa  273  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  48.56 
 
 		 1224 aa  271  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  54.87 
 
 		 1203 aa  271  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  55.56 
 
 		 1188 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  54.46 
 
 		 1185 aa  271  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  57.89 
 
 		 1195 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  54.02 
 
 		 1185 aa  268  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  59.02 
 
 		 1217 aa  267  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.5 
 
 		 1213 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 		 1185 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  55.24 
 
 		 1225 aa  261  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1188 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1188 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 		 1185 aa  258  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.82 
 
 		 1190 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  48.13 
 
 		 1176 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  55.39 
 
 		 1172 aa  249  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  51.87 
 
 		 1255 aa  249  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  55.98 
 
 		 1081 aa  245  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  50.92 
 
 		 1217 aa  246  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  49.79 
 
 		 1173 aa  244  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  42.7 
 
 		 1191 aa  244  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  43.2 
 
 		 1301 aa  244  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  48.52 
 
 		 1198 aa  243  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.73 
 
 		 1178 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  55.28 
 
 		 1188 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.99 
 
 		 1174 aa  239  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  48.32 
 
 		 1222 aa  239  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  47.18 
 
 		 1187 aa  239  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  48.93 
 
 		 1162 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  48.93 
 
 		 1162 aa  235  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  49.34 
 
 		 1162 aa  235  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.08 
 
 		 1162 aa  234  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 		 1214 aa  234  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  46.22 
 
 		 1179 aa  234  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  51.17 
 
 		 1234 aa  232  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  48.75 
 
 		 1162 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  48.75 
 
 		 1162 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  45.14 
 
 		 1168 aa  231  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  43.53 
 
 		 1177 aa  229  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  44.75 
 
 		 1162 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  43.68 
 
 		 1186 aa  228  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1163 aa  226  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  48.03 
 
 		 1162 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 		 1190 aa  226  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  51.49 
 
 		 1191 aa  226  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  42.04 
 
 		 1179 aa  225  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  48.51 
 
 		 1191 aa  224  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  45.73 
 
 		 1138 aa  221  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>