More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3273 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  56.61 
 
 		 1191 aa  1108    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  52.02 
 
 		 1194 aa  1030    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  56 
 
 		 1199 aa  1103    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  55.41 
 
 		 1194 aa  1120    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  53.28 
 
 		 1194 aa  1031    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  57.24 
 
 		 1183 aa  1062    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  51.75 
 
 		 1205 aa  980    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  61.35 
 
 		 1224 aa  1302    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.47 
 
 		 1198 aa  1111    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.72 
 
 		 1198 aa  1103    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  56.55 
 
 		 1218 aa  1049    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  52.44 
 
 		 1217 aa  957    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  56.51 
 
 		 1213 aa  1048    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  55.84 
 
 		 1188 aa  984    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.44 
 
 		 1222 aa  1009    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  57.07 
 
 		 1191 aa  1153    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  51.99 
 
 		 1195 aa  979    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  53.03 
 
 		 1194 aa  1009    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  61.04 
 
 		 1191 aa  1144    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  61.27 
 
 		 1186 aa  1137    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  52.11 
 
 		 1195 aa  984    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  53.72 
 
 		 1214 aa  1012    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1217 aa  1017    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  40.96 
 
 		 1225 aa  752    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  55.43 
 
 		 1181 aa  1012    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  58.71 
 
 		 1203 aa  1104    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  57.4 
 
 		 1222 aa  1140    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  56.92 
 
 		 1195 aa  1105    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  59.04 
 
 		 1188 aa  1084    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1188 aa  2302    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  52.11 
 
 		 1195 aa  984    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  56.96 
 
 		 1227 aa  595  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 		 1187 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  69.47 
 
 		 1234 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.17 
 
 		 1190 aa  483  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 		 1189 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 		 1185 aa  473  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 		 1191 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  51.29 
 
 		 1263 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.7 
 
 		 1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 		 1186 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.34 
 
 		 1175 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.36 
 
 		 1176 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 		 1204 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 		 1176 aa  426  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 		 1176 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 		 1177 aa  399  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.09 
 
 		 1178 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1185 aa  373  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1186 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 		 1167 aa  350  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.89 
 
 		 1167 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 		 1172 aa  345  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1167 aa  345  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.19 
 
 		 1170 aa  337  7e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 		 1198 aa  332  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1164 aa  327  9e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 		 1170 aa  326  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1198 aa  324  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.8 
 
 		 1190 aa  317  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.46 
 
 		 1187 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  32.91 
 
 		 1196 aa  307  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 		 1403 aa  302  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.73 
 
 		 1189 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.73 
 
 		 1189 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.59 
 
 		 1189 aa  290  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  32.14 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  36.46 
 
 		 1174 aa  290  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  32.14 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.59 
 
 		 1174 aa  289  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  32.14 
 
 		 1189 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  32.14 
 
 		 1189 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 		 1308 aa  288  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  29.98 
 
 		 1134 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 		 1189 aa  287  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.51 
 
 		 1198 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  35.11 
 
 		 1185 aa  283  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.14 
 
 		 1153 aa  281  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 		 1177 aa  278  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.67 
 
 		 1185 aa  275  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  33.2 
 
 		 1187 aa  274  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  59.15 
 
 		 1185 aa  274  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  56.41 
 
 		 1186 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  57.26 
 
 		 1179 aa  273  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  43.65 
 
 		 1184 aa  273  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  43.21 
 
 		 1185 aa  270  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 		 1188 aa  268  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 		 1188 aa  268  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.51 
 
 		 1189 aa  267  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.92 
 
 		 1179 aa  263  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  32.39 
 
 		 1184 aa  263  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  43.63 
 
 		 1190 aa  262  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 		 1171 aa  262  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.96 
 
 		 1187 aa  261  6e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.36 
 
 		 1189 aa  255  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  29.15 
 
 		 1191 aa  254  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  22.48 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.57 
 
 		 1175 aa  249  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.71 
 
 		 1191 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.96 
 
 		 1219 aa  244  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>