More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3429 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  53.98 
 
 
1203 aa  963    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  49.92 
 
 
1194 aa  923    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  55.71 
 
 
1194 aa  1132    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  49.84 
 
 
1195 aa  889    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  61.83 
 
 
1183 aa  1128    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.41 
 
 
1172 aa  701    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.02 
 
 
1213 aa  940    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  49.92 
 
 
1194 aa  919    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  51.81 
 
 
1214 aa  968    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  56.48 
 
 
1191 aa  1136    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  55.89 
 
 
1191 aa  968    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  51.26 
 
 
1217 aa  979    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.19 
 
 
1222 aa  951    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  55.25 
 
 
1186 aa  990    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  50.2 
 
 
1194 aa  969    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.6 
 
 
1198 aa  1079    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  48.04 
 
 
1205 aa  878    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  52.08 
 
 
1195 aa  962    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  50 
 
 
1195 aa  890    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.07 
 
 
1225 aa  752    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  59.06 
 
 
1181 aa  1058    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1218 aa  2312    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  54.74 
 
 
1191 aa  1007    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  54.49 
 
 
1199 aa  1075    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.16 
 
 
1198 aa  1076    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  64.83 
 
 
1227 aa  1207    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  57.93 
 
 
1224 aa  1218    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  52.6 
 
 
1222 aa  994    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.74 
 
 
1188 aa  969    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  56.51 
 
 
1188 aa  1142    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  50 
 
 
1195 aa  890    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  58.47 
 
 
1188 aa  602  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  77.7 
 
 
1234 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  35.62 
 
 
1174 aa  513  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.42 
 
 
1187 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.87 
 
 
1190 aa  505  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29 
 
 
1185 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 
1185 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  51.23 
 
 
1263 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.08 
 
 
1187 aa  472  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 
1198 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 
1191 aa  468  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  33.52 
 
 
1177 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.4 
 
 
1176 aa  459  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  62.32 
 
 
1217 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.94 
 
 
1173 aa  443  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.84 
 
 
1178 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.88 
 
 
1177 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.84 
 
 
1179 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1204 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.44 
 
 
1179 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 
1181 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.23 
 
 
1180 aa  369  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.1 
 
 
1164 aa  353  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.48 
 
 
1164 aa  352  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.78 
 
 
1168 aa  352  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 
1170 aa  348  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.9 
 
 
1167 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 
1167 aa  344  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.64 
 
 
1171 aa  344  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  28.41 
 
 
1167 aa  344  7e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1167 aa  342  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 
1175 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 
1182 aa  338  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 
1171 aa  337  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1164 aa  333  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 
1268 aa  332  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 
1170 aa  331  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 
1403 aa  319  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.55 
 
 
1187 aa  314  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 
1190 aa  310  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  32.61 
 
 
1189 aa  299  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.88 
 
 
1174 aa  298  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.03 
 
 
1189 aa  295  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1189 aa  294  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 
1189 aa  294  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.32 
 
 
1189 aa  293  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 
1308 aa  292  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 
1189 aa  291  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.87 
 
 
1189 aa  290  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.87 
 
 
1189 aa  290  9e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 
1189 aa  290  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 
1189 aa  289  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 
1189 aa  289  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 
1189 aa  289  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  40.26 
 
 
1184 aa  290  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.8 
 
 
1153 aa  284  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  34.47 
 
 
1179 aa  283  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  57.14 
 
 
1186 aa  283  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.79 
 
 
1188 aa  282  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.79 
 
 
1188 aa  282  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 
1177 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.08 
 
 
1174 aa  273  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  30.43 
 
 
1186 aa  271  4e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.94 
 
 
1175 aa  269  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  56.73 
 
 
1196 aa  267  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  56.59 
 
 
1185 aa  266  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.14 
 
 
1171 aa  265  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  56.1 
 
 
1185 aa  264  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 
1186 aa  261  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>