More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2124 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.58 
 
 		 1172 aa  693    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  56.16 
 
 		 1218 aa  1011    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  53.51 
 
 		 1205 aa  977    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  61.33 
 
 		 1194 aa  1298    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  54.3 
 
 		 1217 aa  1068    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  56.6 
 
 		 1183 aa  1029    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  57.27 
 
 		 1224 aa  1216    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  54.16 
 
 		 1194 aa  1030    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  55.74 
 
 		 1194 aa  1107    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.45 
 
 		 1213 aa  961    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.09 
 
 		 1225 aa  724    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  51.63 
 
 		 1195 aa  963    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  53.95 
 
 		 1195 aa  1008    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.13 
 
 		 1222 aa  1018    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  54.7 
 
 		 1181 aa  969    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  66.92 
 
 		 1198 aa  1360    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  54.73 
 
 		 1191 aa  1006    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  54.3 
 
 		 1191 aa  1048    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  66.53 
 
 		 1198 aa  1373    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  54.23 
 
 		 1194 aa  1041    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  54.11 
 
 		 1195 aa  1013    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  53.94 
 
 		 1203 aa  967    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  55.63 
 
 		 1214 aa  1069    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1191 aa  2319    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  62.46 
 
 		 1199 aa  1273    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  61.74 
 
 		 1188 aa  1082    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  52.85 
 
 		 1222 aa  1026    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  56.08 
 
 		 1186 aa  1027    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  54.74 
 
 		 1188 aa  982    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  50.16 
 
 		 1217 aa  926    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  57.24 
 
 		 1188 aa  1145    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  54.11 
 
 		 1195 aa  1013    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  56.17 
 
 		 1227 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  59.6 
 
 		 1263 aa  516  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 		 1187 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  68.42 
 
 		 1234 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.28 
 
 		 1190 aa  492  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  34.03 
 
 		 1179 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1190 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.78 
 
 		 1185 aa  458  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 		 1186 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.06 
 
 		 1189 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.82 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.82 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.82 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.06 
 
 		 1189 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.82 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.82 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.84 
 
 		 1189 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.4 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.13 
 
 		 1186 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 		 1176 aa  439  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 		 1189 aa  439  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.67 
 
 		 1176 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1191 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.43 
 
 		 1175 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.09 
 
 		 1189 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1204 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.87 
 
 		 1176 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.26 
 
 		 1174 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.2 
 
 		 1199 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.49 
 
 		 1185 aa  416  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 		 1199 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 		 1199 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.83 
 
 		 1178 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 		 1177 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1163 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 		 1177 aa  383  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.22 
 
 		 1168 aa  363  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 		 1162 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  31.26 
 
 		 1162 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  30.36 
 
 		 1168 aa  353  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.36 
 
 		 1167 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.16 
 
 		 1180 aa  342  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 		 1170 aa  342  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 		 1167 aa  340  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1167 aa  339  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  28.5 
 
 		 1167 aa  339  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 		 1170 aa  335  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  31.07 
 
 		 1174 aa  333  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1142 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 		 1182 aa  330  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1175 aa  326  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  29.9 
 
 		 1173 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.31 
 
 		 1164 aa  321  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 		 1171 aa  311  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1154 aa  304  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.28 
 
 		 1187 aa  303  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  32.18 
 
 		 1196 aa  301  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  29.22 
 
 		 1152 aa  293  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  58.75 
 
 		 1186 aa  292  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.57 
 
 		 1198 aa  290  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.66 
 
 		 1187 aa  289  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  47.24 
 
 		 1174 aa  288  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 		 1403 aa  287  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1188 aa  286  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1188 aa  286  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.21 
 
 		 1174 aa  283  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  35.48 
 
 		 1185 aa  282  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.42 
 
 		 1153 aa  280  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>