More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_19472 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  42.14 
 
 
1179 aa  894    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  45.88 
 
 
1213 aa  918    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  42.88 
 
 
1215 aa  831    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  36.68 
 
 
1171 aa  744    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  100 
 
 
1186 aa  2407    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  25.31 
 
 
1209 aa  265  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.69 
 
 
1174 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.84 
 
 
1191 aa  234  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  23.75 
 
 
1185 aa  231  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1189 aa  222  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.08 
 
 
1184 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  23.59 
 
 
1185 aa  207  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  22.94 
 
 
1175 aa  206  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.99 
 
 
1188 aa  205  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.99 
 
 
1188 aa  205  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  23.98 
 
 
1186 aa  199  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  23.03 
 
 
1175 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 
1189 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 
1204 aa  192  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  23.06 
 
 
1186 aa  191  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  23.24 
 
 
1196 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  23.23 
 
 
1208 aa  191  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.17 
 
 
1217 aa  191  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  21.71 
 
 
1189 aa  189  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.75 
 
 
1149 aa  189  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.21 
 
 
1180 aa  189  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  23.66 
 
 
1191 aa  185  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 
1147 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.03 
 
 
1164 aa  181  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  22.43 
 
 
1177 aa  181  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  22.29 
 
 
1190 aa  178  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  24.29 
 
 
1179 aa  174  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  24.16 
 
 
1175 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  23.56 
 
 
1176 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.83 
 
 
1207 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  21.44 
 
 
1190 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  26.81 
 
 
1188 aa  165  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.12 
 
 
1176 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  22.32 
 
 
1184 aa  164  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  22.83 
 
 
1226 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  22.54 
 
 
1219 aa  157  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  24.25 
 
 
1232 aa  155  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 
1192 aa  152  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.36 
 
 
1174 aa  151  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  25.15 
 
 
1215 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  22.84 
 
 
1186 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.71 
 
 
1193 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  25.71 
 
 
1208 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.03 
 
 
1134 aa  148  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  23.11 
 
 
1148 aa  141  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  26.39 
 
 
1190 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  25.26 
 
 
1183 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1148 aa  134  9e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  23.88 
 
 
1174 aa  134  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.07 
 
 
1153 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  24.01 
 
 
1187 aa  132  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.12 
 
 
1190 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  22.79 
 
 
1476 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  27.08 
 
 
1146 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.04 
 
 
1201 aa  129  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  35.68 
 
 
1172 aa  129  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.8 
 
 
1196 aa  129  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  22.94 
 
 
1170 aa  127  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.21 
 
 
1171 aa  126  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 
1174 aa  125  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.24 
 
 
1199 aa  124  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.09 
 
 
1189 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 
1199 aa  123  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 
1146 aa  122  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 
1199 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  25.22 
 
 
1187 aa  122  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  23.09 
 
 
1189 aa  121  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  32.51 
 
 
1225 aa  121  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.91 
 
 
1196 aa  121  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  23.24 
 
 
1189 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  22.94 
 
 
1170 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  21.48 
 
 
1403 aa  119  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  21.77 
 
 
1189 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 
1198 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 
1198 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.64 
 
 
1194 aa  116  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  23.88 
 
 
1172 aa  116  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  22.64 
 
 
1189 aa  115  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  22.64 
 
 
1189 aa  115  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  21.34 
 
 
1185 aa  115  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  30 
 
 
1227 aa  114  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  22.34 
 
 
1189 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  22.49 
 
 
1189 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  22.62 
 
 
1189 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  22.34 
 
 
1189 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1191 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.08 
 
 
1179 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 
1188 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  33.17 
 
 
1011 aa  113  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  31.91 
 
 
1217 aa  113  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  23.52 
 
 
978 aa  112  3e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  31.53 
 
 
1172 aa  112  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.36 
 
 
1174 aa  112  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  30.05 
 
 
1222 aa  113  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 
1263 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>