More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44736 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_44736  predicted protein  100 
 
 		 153 aa  316  6e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0727103  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  71.88 
 
 		 1215 aa  203  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  73.17 
 
 		 1208 aa  189  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  58.68 
 
 		 1209 aa  140  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  45.9 
 
 		 1232 aa  124  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  39.5 
 
 		 1189 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  39.5 
 
 		 1189 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  47.25 
 
 		 1175 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  43.62 
 
 		 1188 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  45.05 
 
 		 1174 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  46.07 
 
 		 1146 aa  84.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  38.1 
 
 		 1172 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 		 1196 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 		 1189 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  43.96 
 
 		 1193 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 		 1192 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  47.31 
 
 		 1171 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1184 aa  82  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 1174 aa  82  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  44.12 
 
 		 1148 aa  80.9  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  36.7 
 
 		 1149 aa  80.1  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  36.54 
 
 		 1179 aa  79.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1146 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  38.98 
 
 		 1189 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1217 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  42.7 
 
 		 1189 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  38.46 
 
 		 1356 aa  77  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  31.97 
 
 		 1198 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 		 1217 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1146 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  35.48 
 
 		 1224 aa  76.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  39.39 
 
 		 1167 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1194 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  33.93 
 
 		 1208 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  39.39 
 
 		 1167 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  42.5 
 
 		 1219 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 		 1194 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  33.94 
 
 		 1224 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  43.33 
 
 		 1185 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 		 1194 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  34.29 
 
 		 1171 aa  74.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  40.82 
 
 		 1162 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  34.85 
 
 		 1280 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  38.2 
 
 		 1191 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1226 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  39.39 
 
 		 1162 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  43.37 
 
 		 1147 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  31.45 
 
 		 1189 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  32.79 
 
 		 1162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  39.8 
 
 		 1162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  41.41 
 
 		 1173 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1226 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  39.8 
 
 		 1162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  32.14 
 
 		 1205 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  39.8 
 
 		 1162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 1174 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  38.61 
 
 		 1307 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1162 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  32.11 
 
 		 1227 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  39.8 
 
 		 1162 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.89 
 
 		 1182 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 		 1184 aa  72  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 		 1188 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1175 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  38.54 
 
 		 1167 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 		 1188 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  39.8 
 
 		 1162 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  40.22 
 
 		 1403 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  32.79 
 
 		 1162 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  37.37 
 
 		 1171 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  30 
 
 		 1202 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  32.2 
 
 		 1196 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.2 
 
 		 1194 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  37.37 
 
 		 1171 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1167 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  39.6 
 
 		 1318 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.38 
 
 		 1163 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  38.38 
 
 		 1185 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.2 
 
 		 1196 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.2 
 
 		 1196 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1172 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1176 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1167 aa  70.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  36.07 
 
 		 1225 aa  70.5  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1176 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  36.89 
 
 		 1171 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  35.92 
 
 		 1174 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  38.71 
 
 		 1168 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  35.92 
 
 		 1174 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1181 aa  70.5  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1198 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.92 
 
 		 1175 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  37.37 
 
 		 1176 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  32.58 
 
 		 1186 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  34.52 
 
 		 1191 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1196 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  35.92 
 
 		 1204 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 1540 aa  68.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  30 
 
 		 1195 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  40.78 
 
 		 1199 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>